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转录组学 用于分析单细胞RNA测序数据的MATLAB代码。 转录组数据的主要包装类是GeneSet。 它包含许多可视化例程,以及一些旧的聚类方法(Harris等,bioRxiv 2015)。 要使用ProMMT算法进行聚类(Harris等,bioRxiv 2017),请使用MixNB类。 要使用nbtSNE算法,请使用GeneSet中的ComputetSNE函数 要运行潜在因素分析,请使用NBpca 注意:很有可能其中一些代码调用了github仓库中还没有的辅助函数。 给我发电子邮件,如果您遇到错误,我将上载它们。
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Transcriptomics-master
ClosestBigger.m 667B
RedWhiteBlue.m 375B
LogLtoP.m 288B
NBreg.m 5KB
MixNB.m 28KB
RandomNames.m 547B
LogSumExp.m 299B
LICENSE 34KB
WhosBrushed.m 508B
README.md 607B
GeneSet.m 151KB
FavoriteGenes.m 7KB
NBpca.m 7KB
ColoredWords.m 1KB
HsvNotYellow.m 473B
ArrayNormalize.m 1KB
BlueWhiteRed.m 245B
BabyNames.mat 160KB
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