imsig:用于分析实体瘤微环境的免疫细胞基因特征

imsig ：用于分析实体瘤微环境的免疫细胞基因特征 ImSig是一组基因特征，可用于估计组织转录组学数据中免疫细胞的相对丰度，尤其是在癌症数据集中。 ImSig分析背后的基本原理是，对于存在于数据集中的给定免疫细胞类型，仅表达特征基因是不够的，还需要共表达。 ImSig基因被设计为在组织转录组数据中共表达，因此未能在用户的数据集中共表达可能表明它不存在。 一旦用户确定了其数据集中存在的细胞类型，他们就可以计算其相对丰度并使用此程序包进行生存分析。 引文 用于分析实体瘤微环境的免疫细胞基因特征Ajit J. Nirmal、Tim Regan、Barbara B. Shih、David A. Hume、Andrew H. Sims 和 Tom C. Freeman 2018 年 11 月 1 日 (6) (11) 1388-1400； DOI：10.1158/2326-6066.CIR-1