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HoneyBADGER:HMM集成贝叶斯方法,用于从单细胞RNA序列数据中检测CNV和LOH事件
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HoneyBADGER (为hidden马尔可夫模型集成乙ayesian为d etecting从罪克CNV和LOH事件接近角勒-CÊLL - [R NA-SEQ的数据)识别和推断的单个细胞中的CNV和LOH事件的存在和重构使用亚克隆架构单细胞RNA测序数据中的等位基因和表达信息。 以下出版物详细介绍了总体方法: 利益与能力 (1)迭代HMM方法检测CNV (2)贝叶斯分层模型使用等位基因和表达数据推断单个细胞中CNV的概率 (3)从转录数据推断CNV可以实现亚克隆的转录表征和其他综合分析 请访问HoneyBADGER以获取更多教程和信息。 安装 要安装HoneyBADGER ,我们建议使用devtools : require(devtools) devtools::install_github('JEFworks/HoneyBADGER') HoneyBADGER使用JAGS
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HoneyBADGER:HMM集成贝叶斯方法,用于从单细胞RNA序列数据中检测CNV和LOH事件 (178个子文件)
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