spatial-transcriptomics-pipeline

HuBMAP空间转录组学管道 用于处理空间转录组学数据的管道。 发展 此存储库中的代码使用和格式化，并通过Travis CI进行检查。 提供了一个钩子配置，该配置在提交前先运行并isort black 。 在将用于开发的此存储库的每个克隆中运行pre-commit install （在pip install pre-commit到适当的Python环境后，如有必要）。 构建Docker映像 假设您已经安装了Python 软件包的最新安装，请在存储库的根目录中运行build_docker_images 。 发布过程 master分支随时准备就绪，可以随时使用latest标签引用Docker容器。 带有标记的“发布”版本的是通过Python软件包处理的。 要发布新的管道版本，请确保master分支包含要包含在发行版中的所有提交，然后运行 tag_releae_pipeline v0.wha