multiqc

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: MultiQC:将来自多个样本的生物信息学分析的结果汇总到一个报告中 MultiQC是一种工具，用于创建具有交互式图表的单个报告，以对多个样本进行多种生物信息学分析。 MultiQC用Python编写（已通过v3.6 +测试）。它可以在以及通过使用。通过扫描给定目录以查找可识别的日志文件来...
评级：0 浏览量：898 收藏量：0 资源大小：2.15MB 上传时间：2021-03-09

: MultiQC_website:MultiQC的网站文件。见https MultiQC是一种工具，可将多个样本中的生物信息学结果汇总到一个报告中。该存储库包含用于MultiQC网站的文件： ://multiqc.info 有关更多信息，请参见。开发工作要在本地测试，请在根目录中运行docker-compose ...
评级：0 浏览量：67 收藏量：0 资源大小：147.27MB 上传时间：2021-04-12

: multiqc_report.html multiqc_report.html
评级：0 浏览量：81 收藏量：0 资源大小：1.16MB 上传时间：2021-09-11

: MultiQC_TestData:MultiQC的测试数据。见https MultiQC是一种工具，可将多个样本中的生物信息学结果汇总到一个报告中。该存储库包含用于测试MultiQC的文件。这些用于自动并且可以在为MultiQC开发时使用。贡献要将新文件添加到此存储库，请按照以下步骤操作：...
评级：0 浏览量：76 收藏量：0 资源大小：64.75MB 上传时间：2021-05-12

: snakemake_multiqc:在蛇形设计中使用multiQC的示例 snakemake_multiqc 这是一个简单，可重现的示例，其运行fastqc，然后使用测试fastq文件在Snakemake工作流程中运行multiqc。要运行该示例，请从工作目录中运行以下命令，并确保在本地系统或蛇形特定的conda环境中的...
评级：0 浏览量：195 收藏量：0 资源大小：2KB 上传时间：2021-03-06

: example-plugin:MultiQC插件的微型示例 MultiQC插件示例 MultiQC插件的微型示例该示例存储库包含以下代码，以帮助您开始编写自己的MultiQC插件。除主要的MultiQC文档外，还应使用它： ://multiqc.info/docs/#coding-with-multiqc 如有任何疑问，请联系...
评级：0 浏览量：41 收藏量：0 资源大小：21KB 上传时间：2021-05-18

: minion_multiQC:用于小兵数据的多功能QC 用于牛津纳米Kong的Minion Sequencer数据的多功能QC 什么？单个脚本适用于在牛津纳米Kong的Minion测序仪的单个流通池的输出上使用一系列流行的工具执行QC。为什么？因为有很多好的工具，而且如果您真的想知道...
评级：0 浏览量：104 收藏量：0 资源大小：3KB 上传时间：2021-05-16

: atacseq_pipeline:BSF ATAC-seq管道安装适用于MultiQC的atacseq插件： python3 /path/to/atacseq_pipeline/multiqc_atacseq/setup.py install 收集atacseq_config.yaml文件中列出的所有参考数据，并使用正确的路径更新文件。该文件包含不同项目之间...
评级：0 浏览量：139 收藏量：0 资源大小：105KB 上传时间：2021-04-06

: MuWU:Mu-Seq工作流程实用程序 MuWU ... /MuWU/multiqc/multiqc.html 基因和转录水平最终输出表： /MuWU/MuSeq_table_final/Mu_single_GeneIds_gene_lengths_and_stock.csv /MuWU/MuSeq_table_final/Mu_single_TranscriptIds_tra
评级：0 浏览量：96 收藏量：0 资源大小：28KB 上传时间：2021-04-23

: matlab矩阵自动拼接代码-RNA-seq_notes:不断扩大的RNA-seq工具集合 MultiQC，TrimGalore，STAR（两次通过模式），RSEM（用于定量异构体），DESeq2。可以使用ERCC进行标准化。产生更多的未归一化和归一化计数。 PCA，热图，其他可视化。乔纳森·加拉兹卡。 “，” bioRxiv...
评级：0 浏览量：103 收藏量：0 资源大小：28KB 上传时间：2021-05-19

: Bartelo-ANGSD-Final-Project Bartelo-ANGSD-最终项目到目前为止我们所做的3/20将所有9个样本读取下载到SCU中对所有9个fastq文件运行FastQC，并制作了multiQC报告。糖尿病小鼠似乎存在问题。使用主程序集.gtf和.fa文件创建用于STAR比对的参考基因...
评级：0 浏览量：64 收藏量：0 资源大小：9.59MB 上传时间：2021-03-21

: metscale:大都会规模预期的输入是端对端的Illumina FASTQ文件，当前的输出包括已过滤的读数，组合的重叠群，FastQC和QUAST结果的MultiQC报告，元基因组比较估计，分类学分类和功能预测。入门该项目的提供了有关安装和运行工作流程的...
评级：0 浏览量：55 收藏量：0 资源大小：80.62MB 上传时间：2021-03-18

: sagawe:从MDA派生的HiMiSeq（重叠）配对末端Illumina库组装单扩增基因组（SAG）的建议工作流程和随附脚本-... 单扩增基因组-组装工作流程示例（SAG-AWE）该脚本旨在作为建议的工作流程，用于组装和分析从Illumina Hi- / Mi-Seq配对末端...虚线箭头表示由MultiQC读取的报告灰色箭头表示将来的添加。用法/帮助示例 Single Ampl
评级：0 浏览量：148 收藏量：0 资源大小：28KB 上传时间：2021-03-25

: rump:可再生的非靶向代谢组学数据处理管道利用MultiQC生成交互式报告; 通路分析用mummichog完成; 未知代谢物的搜寻用CEU Mass Mediator完成。请注意，由于服务器不稳定，默认情况下，与CEU Mass Mediator进行的不知道搜索相关的进程是关闭的，可以通过将...
评级：0 浏览量：147 收藏量：0 资源大小：1.95GB 上传时间：2021-05-04

: joe-benthos:胡德运河和圣胡安eDNA序列数据的生物信息学管道初始方法和结果工作流程从Gannett检索数据运行MultiQC 使用解复用样本dada2的去噪和滤波序列使用Insect 1.2分配分类单元要重现此工作流程，请参见目录结构/analysis/用于分类单元分配数据整形，数据探索和可视化的...
评级：0 浏览量：58 收藏量：0 资源大小：39.38MB 上传时间：2021-03-11

: 方法 MultiQC链接数据处理步骤第一阶段管道 Broad GP目前以hg19 bams的形式提供RNA-seq数据。当GP提供新样品时，我们手动将新的.bam和.bai文件复制到gs://macarthurlab-rnaseq/[batch name]/hg19_bams/ 运行step1...
评级：0 浏览量：65 收藏量：0 资源大小：187.32MB 上传时间：2021-03-04

: illuminatus:Illumina运行处理的全知全能的开明管道运行bcl2fastq，各种QC步骤，未分配的条形码分析和MultiQC报告。错误条件得到了强有力的处理，并报告给RT。该手册以Google文档的形式维护。我们（目前）还没有一本可供公众使用的手册，但是如果您认为自己想...
评级：0 浏览量：87 收藏量：0 资源大小：3.15MB 上传时间：2021-04-06

: chimera-quantseq Chimera 项目的 QuantSeq 分析流程此 GitHub 存储库包含工作流程，用于对创建的 RNA-seq 数据集进行可重复分析。是一种 RNA-seq 检测，可量化 mRNA 转录本的 3'UTR 亚型，并能够研究替代的聚腺苷酸化... 运行MultiQC
评级：0 浏览量：64 收藏量：0 资源大小：333.77MB 上传时间：2021-08-04

: WGSpipe-nf:WGSWES数据分析的简便快捷管道因此您可以运行nextflow自更新以将NEXTFLOW更新为新版本-STEP02：-CONDA环境部署（可选）：要求（fastqc，fastp，multiqc，bwa，gatk，annovar，samtools） conda env create -f environment.yaml -此代码将为wgs / ...
评级：0 浏览量：96 收藏量：0 资源大小：21KB 上传时间：2021-03-17

: dropSeqPipe:SingleCell RNASeq预处理snakemake工作流程描述该管道基于提供的和dropeq工具。它允许从您的单细胞RNA序列实验的原始数据开始，一直到具有QC图的最终计数矩阵。这是我们在实验室中使用的工具，用于改进我们的wetlab协议，并提供了一个简单的框架来重现和...
评级：0 浏览量：80 收藏量：0 资源大小：1.93MB 上传时间：2021-05-08

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