没有合适的资源?快使用搜索试试~ 我知道了~
rump:可再生的非靶向代谢组学数据处理管道
共306个文件
mzxml:56个
txt:44个
png:43个
需积分: 14 2 下载量 26 浏览量
2021-05-04
21:30:47
上传
评论
收藏 1.95GB ZIP 举报
温馨提示
用于非目标代谢组学数据分析的可复制管道。 执照 根据的条款,该程序是作为开源软件发行的。 用法 请参阅我们的了解如何安装和使用RUMP 帮助信息 RUMP可以在命令行上显示用法信息: Nextflow main.nf --help true 组件 RUMP接受.mzXML和.mzXL文件。 使用MZmine-2.53并行处理文件; 使用Python3代码计算了几个统计学家; 利用MultiQC生成交互式报告; 通路分析用mummichog完成; 未知代谢物的搜寻用CEU Mass Mediator完成。 请注意,由于服务器不稳定,默认情况下,与CEU Mass Mediator进行的不知道搜索相关的进程是关闭的,可以通过将参数--unknown_search设置为“ 1”来打开该--unknown_search 。 目前包括统计分析 学生t检验:测试两组样本之间的某些峰强度是否存在显
资源详情
资源评论
资源推荐
收起资源包目录
rump:可再生的非靶向代谢组学数据处理管道 (306个子文件)
nextflow.config 11KB
base.config 4KB
HiPerGator.config 4KB
local.config 3KB
test.config 1KB
pos_data_before_blank_subtraction.csv 32.09MB
pos_vd_both_nobg.csv 32.06MB
pos_vd_group2_nobg.csv 18.57MB
neg_data_before_blank_subtraction.csv 17.12MB
neg_vd_both_nobg.csv 17.11MB
pos_vd_group1_nobg.csv 13.5MB
neg_vd_group2_nobg.csv 8.6MB
neg_vd_group1_nobg.csv 8.52MB
pos_vd_both_withbg.csv 4.15MB
pos_data_after_blank_subtraction.csv 4.15MB
unknown_search_pos_nobg.csv 3.82MB
neg_vd_both_withbg.csv 3.16MB
neg_data_after_blank_subtraction.csv 3.16MB
pos_vd_group2_withbg.csv 2.54MB
unknown_search_neg_nobg.csv 1.93MB
neg_vd_group2_withbg.csv 1.81MB
pos_vd_group1_withbg.csv 1.62MB
neg_vd_group1_withbg.csv 1.36MB
pos_data.csv 828KB
neg_data.csv 827KB
unknown_search_neg_withbg.csv 523KB
unknown_search_pos_withbg.csv 487KB
negative_library.csv 38KB
positive_library.csv 38KB
R_packages.csv 9KB
neg_design.csv 1KB
pos_design.csv 1KB
pos_design.csv 340B
neg_design.csv 326B
Dockerfile 2KB
.gitignore 1KB
nextflow_report.html 2.85MB
multiqc_report.html 1.44MB
result.html 163KB
result.html 154KB
result.html 138KB
result.html 129KB
result.html 101KB
result.html 87KB
timeline.html 12KB
Metabolomics Pipeline.jpeg 203KB
Metabolomics RUMP Logo.jpg 4KB
nextflow_schema.json 19KB
LICENSE 1KB
CONTRIBUTING.md 7KB
README.md 4KB
bug_report.md 2KB
PULL_REQUEST_TEMPLATE.md 1KB
feature_request.md 806B
README.md 256B
README.md 117B
README.md 116B
README.md 78B
CHANGELOG.md 72B
README.md 64B
README.md 0B
output.md 0B
usage.md 0B
QE2_sbs_11_7[10N].mzXML 87.78MB
QE2_sbs_11_36[31NOC].mzXML 87.66MB
QE2_sbs_11_15[29NOC].mzXML 86.65MB
QE2_sbs_11_12[30NOC].mzXML 86.39MB
QE2_sbs_11_8[9N].mzXML 84.93MB
QE2_sbs_11_41[32NOC].mzXML 84.66MB
QE2_sbs_11_22[26NOC].mzXML 84.28MB
QE2_sbs_11_23[28NOC].mzXML 84.27MB
QE2_sbs_11_40[13N].mzXML 83.45MB
QE2_sbs_11_11[27NOC].mzXML 82.94MB
QE2_sbs_11_28[12N].mzXML 81.69MB
QE2_sbs_11_20[11N].mzXML 80.78MB
QE2_sbs_11_19[16N].mzXML 80.37MB
QE2_sbs_11_33[25NOC].mzXML 79.79MB
QE2_sbs_11_46[14N].mzXML 79.73MB
QE2_sbs_11_32[15N].mzXML 78.6MB
QE2_sbs_11_16[blank].mzXML 77.31MB
QE2_sbs_11_42[blank].mzXML 75.65MB
QE2_sbs_11_29[blank].mzXML 73.41MB
QE2_sbs_11_1[blank].mzXML 71.86MB
QE2_sbs_11_2[blank].mzXML 69.64MB
QE2_sbs_11_3[blank].mzXML 69.49MB
QE2_sbs_11_23[28NOC]n.mzXML 59.23MB
QE2_sbs_11_28[12N]n.mzXML 59.03MB
QE2_sbs_11_41[32NOC]n.mzXML 58.97MB
QE2_sbs_11_15[29NOC]n.mzXML 58.96MB
QE2_sbs_11_22[26NOC]n.mzXML 58.62MB
QE2_sbs_11_32[15N]n.mzXML 58.6MB
QE2_sbs_11_40[13N]n.mzXML 58.57MB
QE2_sbs_11_46[14N]n.mzXML 58.46MB
QE2_sbs_11_7[10N]n.mzXML 58.4MB
QE2_sbs_11_19[16N]n.mzXML 58.27MB
QE2_sbs_11_12[30NOC]n.mzXML 58.27MB
QE2_sbs_11_36[31NOC]n.mzXML 58.07MB
QE2_sbs_11_11[27NOC]n.mzXML 58.02MB
QE2_sbs_11_8[9N]n.mzXML 57.69MB
QE2_sbs_11_20[11N]n.mzXML 57.25MB
共 306 条
- 1
- 2
- 3
- 4
帝哲
- 粉丝: 34
- 资源: 4669
上传资源 快速赚钱
- 我的内容管理 展开
- 我的资源 快来上传第一个资源
- 我的收益 登录查看自己的收益
- 我的积分 登录查看自己的积分
- 我的C币 登录后查看C币余额
- 我的收藏
- 我的下载
- 下载帮助
最新资源
- 实现了7种排序算法.三种复杂度排序.三种nlogn复杂度排序(堆排序,归并排序,快速排序)一种线性复杂度的排序.zip
- 冒泡排序 直接选择排序 直接插入排序 随机快速排序 归并排序 堆排序.zip
- 课设-内部排序算法比较 包括冒泡排序、直接插入排序、简单选择排序、快速排序、希尔排序、归并排序和堆排序.zip
- Python排序算法.zip
- C语言实现直接插入排序、希尔排序、选择排序、冒泡排序、堆排序、快速排序、归并排序、计数排序,并带图详解.zip
- 常用工具集参考用于图像等数据处理
- 音乐展示网页、基于Stenography的图像数字水印添加与提取,以及基于颜色矩和Tamura算法的图像相似度评估算法py源码
- 基于EmguCV(OpenCV .net封装),图像数字水印加解密算法的实现,其中包含最低有效位算法,离散傅里叶变换算法+文档书
- 基于matlab+DWT的图像水印项目,数字水印+源代码+文档说明+图片+报告pdf
- (优秀毕业设计)基于python实现的数字图像可视化水印系统的设计与实现,多种数字算法实现+源代码+文档说明+理论演示pdf
资源上传下载、课程学习等过程中有任何疑问或建议,欢迎提出宝贵意见哦~我们会及时处理!
点击此处反馈
安全验证
文档复制为VIP权益,开通VIP直接复制
信息提交成功
评论0