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matlab矩阵自动拼接代码-RNA-seq_notes:不断扩大的RNA-seq工具集合
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2021-05-19
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matlab矩阵自动拼接代码不断扩大的RNA-seq工具集合 RNA-seq相关工具和基因组数据分析资源。 请, ! 有关其他编程和与基因组学有关的说明,请参见。 表中的内容 流水线 。 FastQC / MultiQC,TrimGalore,STAR(两次通过模式),RSEM(用于定量异构体),DESeq2。 可以使用ERCC进行标准化。 产生更多的未归一化和归一化计数。 PCA,热图,其他可视化。 乔纳森·加拉兹卡。 “,” bioRxiv,2020年11月10日 -来自FASTQ文件或直接来自GEO的基于R的RNA-seq处理管道。 读取针对两组差异分析的元数据。 竞争对手:Galaxy,R的总RNA序列分析软件包(TRAP),EasyRNASeq,READemption。 可通过Conda安装 Seelbinder,Bastian,Thomas Wolf,Steffen Priebe,Sylvie McNamara,Silvia Gerber,Reinhard Guthke和Joerg Linde。 “。” 预印本。 生物信息学,2019年9月16日 前处理 -修整的适
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