基因组下载

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基因组下载

: 人类参考基因组 二、如何下载参考基因组 在 linux 中下载参考序列数据库： 1. hg38：wget http://hgdownload.cse.ucsc.edu/goldenPath/hg38/bigZips/hg38.fa.gz 2. hg19：wget ...
评级：0 浏览量：1274 收藏量：0 资源大小：85KB 上传时间：2020-12-21

: 日本晴参考基因组 粳稻参考基因组日本晴主要常用的有两个版本，分别为The Rice Annotation Project (RAP)（https://rapdb.dna.affrc.go.jp/index.html）和 Rice Genome Annotation Project （RGAP7，MSU） ...
评级：0 浏览量：1734 收藏量：1 资源大小：12KB 上传时间：2018-12-11

: 基因组 基因组
评级：0 浏览量：88 收藏量：0 资源大小：3.86MB 上传时间：2021-02-18

: 基因组学概论 基因组学概论ppt
评级：1 浏览量：557 收藏量：0 资源大小：3.73MB 上传时间：2017-03-02

: 功能基因组学ppt 功能基因组学，来源于网络，有需要的可以下载。
评级：0 浏览量：256 收藏量：0 资源大小：2.77MB 上传时间：2015-07-15

: Augustus:基因组注释与AUGUSTUS AUGUSTUS是一种在一个或多个基因组中查找基因及其结构的程序。安装视窗 Windows用户可以完全按照下面针对Linux的说明，使用Linux的Windows子系统（WSL）安装AUGUSTUS。介绍了如何为AUGUSTUS设置WSL。 Ubuntu ...
评级：0 浏览量：1212 收藏量：1 资源大小：211.78MB 上传时间：2021-05-14

: BugBuilder:免提微生物基因组组装它利用一系列现有工具来生成带注释的基因组组装（可选地与参考基因组对接），输出描述已组装重叠群的EMBL格式记录，以及描述支架的AGP v2文件。必需的输入是来自配对末端测序运行片段的fastq格式读取，以及可选的...
评级：0 浏览量：77 收藏量：0 资源大小：2.27MB 上传时间：2021-05-02

: 基因组研究技术 基因组研究已经如火如荼，本教材供专业学习生物的人士下载学习。
评级：0 浏览量：29 收藏量：0 资源大小：6.91MB 上传时间：2013-01-27

: prokka:快速原核基因组注释 Prokka：快速原核基因组注释介绍全基因组注释是识别一组基因组DNA序列中感兴趣的特征，并用有用的信息标记它们的过程。 Prokka是一种软件工具，可快速注释细菌，古细菌和病毒基因组，并生成符合标准的输出文件。安装...
评级：5 浏览量：1441 收藏量：1 资源大小：107.39MB 上传时间：2021-05-10

: 天然五倍体泥鳅线粒体基因组全序列分析天然五倍体泥鳅线粒体基因组全序列分析，于永耀，周小云，采用PCR产物直接测序法，对天然五倍体泥鳅的线粒体基因组全序列进行了测定，并对其基因组特点进行了分析。结果显示，五倍体泥鳅的
评级：0 浏览量：93 收藏量：0 资源大小：511KB 上传时间：2020-01-02

: Genome Downloader:根据搜索词从 NCBI 下载基因组数据。-开源 GenomeDownloader 是一个命令行 Perl 程序，用于从 NCBI 下载基因组数据（使用 wget）。最近（2017-10）已完全重写，以与 NCBI 的“新”数据组织结构一起使用。也可以选择组装完成水平（即 Contig、Scaffold、...
评级：0 浏览量：655 收藏量：3 资源大小：7KB 上传时间：2021-06-29

: 武汉2019冠状病毒基因组的生物信息学分析武汉2019冠状病毒基因组的生物信息学分析这是一份中英都有的文档，包含了武汉2019冠状病毒基因组的生物信息学分析，大家要下载下来看看。
评级：5 浏览量：240 收藏量：0 资源大小：80KB 上传时间：2020-04-30

: vg：用于处理基因组变异图的工具 vg变异图数据结构，互换格式，对齐方式，基因分型和变异调用方法变异图提供了许多基因组序列的简洁编码。变异图（特别是在vg中实现）由以下部分组成：节点，由序列和ID标记边缘，通过两个端点的任意一端连接两个...
评级：0 浏览量：742 收藏量：1 资源大小：24.27MB 上传时间：2021-02-26

: 基因组文库的构建美食该如何制作？食品安全以什么为标准？用什么来检测食品成分？这么一份基因组文库的构建来为你解开心中...该文档为基因组文库的构建，是一份很不错的参考资料，具有较高参考价值，感兴趣的可以下载看看
评级：0 浏览量：39 收藏量：0 资源大小：286KB 上传时间：2021-01-02

: BPGA:超快速泛微生物基因组分析工具。-开源 BPGA是用于微生物基因组的快速泛基因组分析工具。除了常规的泛基因组图谱，BPGA还提供详细的统计数据和序列及其下游分析，例如KEGG / COG分配和基于核心以及泛基因组的系统发育。此外，它还研究具有极端/非典型GC...
评级：0 浏览量：1306 收藏量：2 资源大小：79.12MB 上传时间：2021-05-27

: 六倍体小麦基因组注释流程构建与优化野生小麦是异源六倍体，基因组规模较大（约14 GB），且包含大量重复序列.为了培育具有优良性状的新品种，首先要定位控制目标性状的基因，因此建立一个完整准确的基因组注释软件流程至关重要.传统的基因组注释方法...
评级：0 浏览量：325 收藏量：0 资源大小：1.04MB 上传时间：2021-05-06

: 基因组rRNA预测 基因组核糖体RNA预测，应用于真菌、细菌及线粒体，并统计rRNA类型，拷贝数，序列长度在基因组当中的占比，同时能够输出rRNA序列。
评级：0 浏览量：331 收藏量：0 资源大小：7KB 上传时间：2017-11-19

: progressiveCactus:分发包装，用于“仙人掌”多基因组比对仪。依赖关系链接为子模块重要说明：渐进式仙人掌已移至此处：这个版本a）是积极维护和开发的，并且b）通过使用Toil代替JobTree支持云计算平台渐进仙人掌手册Glenn Hickey的（） Progressive Cactus是一个全基因组比对软件包。安装要求吉特...
评级：0 浏览量：412 收藏量：0 资源大小：46KB 上传时间：2021-05-12

: 基因组工具：GenomeTools基因组分析系统 Genome工具 GenomeTools基因组分析系统是一个免费的生物信息学工具集合（在基因组信息学领域），组合成一个名为gt二进制文件。它基于一个名为libgenometools的C库，该库包含用于高效，便捷地实现序列和注释处理软件...
评级：0 浏览量：1101 收藏量：0 资源大小：15.86MB 上传时间：2021-01-30

: FastANI:快速全基因组相似度（ANI）估计 FastANI专为快速，无比对的全基因组平均核苷酸识别（ANI）计算而开发。 ANI被定义为两个微生物基因组之间共有的直系同源基因对的平均核苷酸同一性。 FastANI支持完整和草图基因组装配的成对比较。它的基本过程遵循...
评级：0 浏览量：2172 收藏量：0 资源大小：2.85MB 上传时间：2021-05-12

: ctag:图基因组浏览器 Abeel的指导下制造的基因组种群图可视化仪入门首先，请先存储库中标记的一个JAR。最好采用最新构建的JAR。要启动该应用程序，只需双击下载的JAR。如果这不能启动您的应用程序，则可能意味着您需要。启动...
评级：0 浏览量：114 收藏量：0 资源大小：429KB 上传时间：2021-05-08

: enrichM:MAG比较基因组学的工具箱 EnrichM是一套用于大型元基因组组装基因组（MAG）的比较基因组学工具。当前功能包括： MAG的基本注释管道。使用KEGG模块作为参考来确定MAG编码的代谢途径的管道（尽管可以指定自定义途径）用于识别在用户定义...
评级：0 浏览量：394 收藏量：0 资源大小：28.43MB 上传时间：2021-05-09

: 二次从头基因组组装算法_assembly_代码_下载 AlignGraph 是一种软件，它通过在密切相关生物体的参考基因组提供的帮助下重新组装重叠群或支架来扩展和连接它们。简短的手册系统要求 AlignGraph 适用于具有 Linux 操作系统的 32 位或 64 位机器。建议使用至少...
评级：0 浏览量：72 收藏量：0 资源大小：229KB 上传时间：2022-06-10

: 脑肿瘤放射基因组分类的DICOM图像转换数据集脑肿瘤放射基因组分类的DICOM图像转换数据集，本数据集为TFRecords文件，由RSNA-MICCAI脑肿瘤放射基因组分类数据集的DICOM文件转换而来。train文件夹有465个样本，valid文件夹有117个样本。每一个都有形状(128,128,...
评级：0 浏览量：101 收藏量：0 资源大小：935.7MB 上传时间：2022-12-15

: igv.js:基于整合基因组学查看器的可嵌入基因组可视化组件 igv.js igv.js是由团队开发的可嵌入交互式基因组可视化组件。以下是示例和快速入门指南。有关更多文档，请参见。例子快速开始安装igv.js由一个没有外部依赖性的javascript文件组成。要直接链接到当前版本，请...
评级：0 浏览量：940 收藏量：0 资源大小：8.19MB 上传时间：2021-04-10

: GenoViz:基因组学可视化软件-开源 GenoViz 为基因组学中的数据可视化和数据共享提供软件应用程序和可重复使用的组件。我们的主要产品是*集成基因组浏览器（IGB）* GenoViz SDK有关IGB的更多信息，请访问https://bioviz.org。 IGB 的源代码可从 ...
评级：0 浏览量：59 收藏量：0 资源大小：106.68MB 上传时间：2021-05-30

: 建昌鸭线粒体基因组全序列分析 (2010年) 参照近源物种线粒体基因组序列设计引物15对,用PCR产物直接测序法测得建昌鸭(Anasplatyrhychos)线粒体基因组全序列,初步分析其特点和各基因的定位。结果显示:建昌鸭线粒体基因组全长16606bp,碱基A、T、G、C的含量分别...
评级：0 浏览量：110 收藏量：0 资源大小：227KB 上传时间：2021-05-15

: fgwas:功能基因组学和全基因组关联研究 fgwas是用于将功能基因组信息整合到全基因组关联研究（GWAS）中的命令行工具。基本设置如下：您已经执行了GWAS或许多GWAS的荟萃分析，并确定了数十个影响疾病或性状的基因座（如果至少有20个独立的p-位点，我们的...
评级：0 浏览量：249 收藏量：0 资源大小：5.94MB 上传时间：2021-04-29

: 稻瘟病菌基因信息查询下载APP 本APP属于个人开发，对接爬取NCBI信息，可查询单个基因信息，也可批量下载基因的大小，CDS，mRNA及序列，简单操作，减少等待NCBI网页反应时间。（如果研究者对于genebank网页中的信息还有需要，可以留言，我可能会...
评级：0 浏览量：201 收藏量：0 资源大小：10.61MB 上传时间：2020-05-02

: jbrowse:使用JavaScript和HTML5构建的现代基因组浏览器要安装jbrowse，请访问并下载最新的JBrowse zip文件。有关设置示例实例的教程，请参见上的说明。从GitHub安装JBrowse（面向开发人员）要从GitHub安装，您只需克隆存储库并运行setup.sh脚本即可 git clone ...
评级：0 浏览量：264 收藏量：0 资源大小：13.96MB 上传时间：2021-05-02

: MULTOVL:基因组区域的多重重叠-开源 MULTOVL程序套件在基因组区域之间发现多个重叠。 MULTOVL算法可以检测几种区域重叠。除了N折重叠之外，您还可以检测孤立区域，这些孤立区域是不与输入数据集中的任何其他区域重叠的输入区域，并且联合重叠是在某处...
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: Genrich:检测基因组富集的位点 Genrich：检测基因组富集的位点目录 I / O文件和选项所需文件可选文件筛选选项未配对的比对 ATAC序列模式调峰参数各种各样的完整的分析示例警告讯息计算要求接触介绍 Genrich是基因组富集测定（例如ChIP...
评级：0 浏览量：153 收藏量：0 资源大小：111KB 上传时间：2021-05-05

: biograph:BioGraph基因组学分析平台传记这是 BioGraph 基因组分析平台的代码库。它可免费用于学术用途。有关详细信息，请参阅许可证文件。快速开始从下载预先构建的二进制文件。发行版是静态构建的，应该在最新的 Linux 发行版上运行。除了发布...
评级：0 浏览量：348 收藏量：0 资源大小：231.94MB 上传时间：2021-07-23

: 基因组工程和分析软件_Python_JavaScript_下载.zip 基因组工程和分析软件_Python_JavaScript_下载.zip
评级：0 浏览量：20 收藏量：0 资源大小：107.65MB 上传时间：2023-04-04

: G2P：用于基因型模拟、表型模拟和功效评估的全基因组关联研究模拟工具___下载.zip G2P：用于基因型模拟、表型模拟和功效评估的全基因组关联研究模拟工具___下载.zip
评级：0 浏览量：68 收藏量：1 资源大小：42.58MB 上传时间：2023-04-16

: ucsc-xena-server:交钥匙功能基因组学数据服务器通过UCSC癌症基因组学网络工具，可以在笔记本电脑或机构服务器上查看私有基因组数据以及公共数据集，而无需将数据移到其他地方。安装从下载。用法使用安装程序双击，或从应用程序菜单中选择。这将启动UCSC ...
评级：0 浏览量：87 收藏量：0 资源大小：1.8MB 上传时间：2021-05-02

: BWT:分布式基因组序列比对器下载档案： : download 将其解压缩到BWT文件夹使用2名工人在本地计算机上运行测试 $ ./scripts/start_local.sh SRR770176_1.fastq GL000193.1 2 集群的节点要求友好Linux en Erlang OTP 17 吉特互联网主节点...
评级：0 浏览量：115 收藏量：0 资源大小：3.19MB 上传时间：2021-05-05

: jenome:玩弄人类基因组和Clojure 首先，从下载一些.2bit基因组代码。或者，使用resources/sacCer3.2bit 。然后， lein run 另请参见src/jenome/examples.clj注释掉的示例表达式。执照版权所有（C）2012-2015 John Jacobsen 与clojure一样，...
评级：0 浏览量：65 收藏量：0 资源大小：2.84MB 上传时间：2021-05-06

: cbioportal, 用于癌症基因组学的cBioPortal.zip cbioportal, 用于癌症基因组学的cBioPortal cBioPortal癌症基因组学的cBioPortal提供了大规模癌症基因组数据集的可视化。分析和下载。 cBioPortal是自由软件：可以在Free中发布和/或者修改它，这是由自由软件基础...
评级：0 浏览量：284 收藏量：0 资源大小：43.67MB 上传时间：2019-09-18

: ClonalOrigin:使用全基因组序列推断细菌中的同源重组 ClonalOrigin对细菌基因组样本的序列进行比较分析，以重建其祖先发生的重组事件。下文介绍了ClonalOrigin： Didelot X，Lawson D，Darling A，Falush D（2010）使用全基因组序列推断细菌中的同源重组。遗传学...
评级：0 浏览量：143 收藏量：0 资源大小：222KB 上传时间：2021-05-20

: sequence-finder:在细菌基因组中搜索物种特定区域序列查找器小型快速Python管道，用于搜索细菌基因组中特定于物种的区域。要求您需要安装：高炉- conda install -c bioconda blast安装克隆回购git clone git@github.com:polinchen98/sequence-finder.git 安装套件...
评级：0 浏览量：101 收藏量：0 资源大小：4KB 上传时间：2021-03-15

: java8看不到源码-PBrowse:实时协作基因组浏览器看不到源码PBrowse：一个基于网络的平台，用于实时协作探索和共享基因组数据作者：Peter S. Szot、Andrian Yang、Joshua Ho 接触：版权所有 (c) 2016, Victor Chang 心脏研究所该存储库包含 PBrowse Web 应用程序...
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: Bayesian Estimated Core Genome:用于估计一组基因组序列的核心基因组的管道-开源这些工具集（贝叶斯估计核心基因组工具）旨在提供一个简单的管道，用于基于从Genome Comparator [1]获得的输出来计算一组基因组序列的估计核心基因组。除了计算估计的核心基因组外，还提供了工具，用于计算Genome ...
评级：0 浏览量：129 收藏量：1 资源大小：4.41MB 上传时间：2021-05-27

: defining_genomic_regions:定义基因组中的区域定义基因组区域参考基因组只是一串 A、C、G 和 T。然而，基因组中有许多功能元件，并且已经进行了大量的努力来注释基因组。任务是对人类和小鼠基因组中的基因和基因变异进行编目。协调并提供拟南芥的基因组注释...
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: white-spruce-organelles-paper:白云杉（Picea glauca）的有机体基因组 白云杉（云杉）的有机体基因组：组装和注释。 Shaun D Jackman，Rene Warren，Ewan Gibb，Ben Vandervalk，Hamid Mohamadi，Justin Chu，Anthony Raymond，Stephen Pleasance，Robin Coope，Mark R Wildung，Carol ...
评级：0 浏览量：91 收藏量：0 资源大小：1.84MB 上传时间：2021-05-15

: snpsandme:显示和分析23andme基因组数据嗅探我（简称SNP）可识别基因组中的单个位置，23andme使用它来存储您的信息。这非常方便，因为有几个大型数据库可以提供有关SNP功能的信息。该应用程序的目标是：查看您的23andme数据，并同时访问NIH数据库。 ...
评级：0 浏览量：86 收藏量：0 资源大小：408KB 上传时间：2021-04-12

: racon:超快速共有模块，用于长的未校正读段的原始从头基因组组装 Racon的目标是与通过使用纠错和共识步骤的组装方法生成的输出相比，生成质量相似或更好的基因组共识，同时提供比那些方法快几倍的速度。它支持Pacific Biosciences和Oxford Nanopore Technologies产生的数据。 ...
评级：0 浏览量：163 收藏量：1 资源大小：2.95MB 上传时间：2021-05-03

: smudgeplot:利用全基因组测序数据推断倍性和杂合性结构我们能够通过比较kmer对覆盖率的总和（CovA + CovB）与它们的相对覆盖率（CovB /（CovA + CovB））来解开基因组结构。这种方法还使我们能够分析重复，各种倍性水平等晦涩的基因组。污点图是从原始的或什至更好的...
评级：0 浏览量：926 收藏量：0 资源大小：51KB 上传时间：2021-05-08

: r-acidgenomes：用于下载和处理基因组注释的工具包酸性基因组 用于下载和处理基因组注释的工具包。安装法 install.packages( pkgs = " AcidGenomes " , repos = c( " https://r.acidgenomics.com " , getOption( " repos " ) ) )
评级：0 浏览量：99 收藏量：0 资源大小：157KB 上传时间：2021-02-13

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