粳稻参考基因组日本晴主要常用的有两个版本,
分别为The Rice Annotation Project (RAP)(https://rapdb.dna.affrc.go.jp/index.html)和
Rice Genome Annotation Project (RGAP7,MSU)
(http://rice.plantbiology.msu.edu/index.shtml)。分别由两个团队进行维护,因此其注释基因数量和基因登录号也不相同。
RAP格式为“Os-Chr-g-number”,MSU格式为“LOC_Os-Chr-g-number”。