第 ３２ 卷第 ２ 期 西 南 大 学 学 报 （自然科学版） ２０１０ 年 ２ 月
Ｖｏｌ畅３２ Ｎｏ畅２ Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｓｏｕｔｈｗ ｅｓｔ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ （Ｎａｔｕｒａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅ Ｅｄｉｔｉｏｎ） Ｆｅｂ畅 ２０１０
文章编号 ：１６７３ ９８６８（２０１０）０２ ００３８ ０６
建 昌 鸭 线 粒 体 基 因 组 全 序 列 分 析
①
涂剑锋
１ ，２
， 黄银花
１
， 刘三凤
３
， 李 宁
１
１畅 中国农业大学 农业生物技术国家重点实验室 ，北京 １０００９４ ；２畅 中国农业科学院 特产研究所 ，吉林 吉林 １３２１０９ ；
３畅 江西农业大学 动物科技学院 ，南昌 ３３００４５
摘要 ：参照近源物种线粒体基因组序列设计引物 １５ 对 ，用 ＰＣＲ 产物直接测序法测得建昌鸭（Ａ ｎａｓ
ｐ
ｌａｔ
ｙ
ｒｈｙｃｈｏｓ ）
线粒体基因组全序列 ，初步分析其特点和各基因的定位 ．结果显示 ：建昌鸭线粒体基因组全长 １６ ６０６ ｂｐ ，碱基 Ａ 、
Ｔ 、 Ｇ 、Ｃ 的含量分别为 ２９畅２１％ 、２２畅１９％ 、１５畅７７％ 、３２畅８３％ ，包含 １３ 个蛋白质编码基因 、２ 个 ｒＲＮＡ 基因 、２２ 个
ｔＲＮＡ 基因和 １ 个非编码调控区（Ｄ‐ｌｏｏｐ） ，基因组结构和已知雁形目鸟类的完全相同 ．基于线粒体 １３ 个蛋白质编
码基因序列 ，采用邻接法构建雁形目 ８ 个物种的系统进化树 ，所得结果与传统的系统分类基本一致 ．
关 键 词 ： 建昌鸭 ；线粒体基因组 ；序列分析
中图分类号 ： Ｓ８１３畅１ 文献标识码 ： Ａ
我国是世界上鸭品种资源最丰富的国家 ，仅地方品种就有 ２７ 个之多 ，其中建昌鸭等 ８ 个品种已被列入
国家重点保护品种 ．建昌鸭在分类学上隶属鸟纲雁形目（Ａｎｓｅｒｉｆｏｒｍ ）鸭科（Ａｎａｔｉｄａｅ）河鸭属 ，主要产于四
川凉山州安宁流域的西昌 、德昌等地 ．建昌鸭有生长快 、成熟早 、 体格大 、产肉多 、皮脂少 、 肥肝大 、 杂交
优势强等特点 ，已成为我国鸭类养殖业的重要组成部分 ．
目前 ，对建昌鸭遗传结构研究的资料不多 ，主要有核型及染色体带型分析
［１］
、蛋白电泳分析
［２］
、微卫
星多态分析
［３ ４］
以及线粒体 ＤＮＡ （ｍｔＤＮＡ ）限制性酶切图谱分析
［５］
等 ，很少有以 ｍｔＤＮＡ 作为遗传标记进
行研究的报道 ．动物 ｍｔＤＮＡ 具有分子结构简单 、母性方式遗传 、进化速度快等特点 ，是从分子水平研究物
种遗传结构和起源进化的重要遗传标记
［６ ８］
．基于以上原因 ，我们测定了建昌鸭 ｍｔＤＮＡ 全序列 ，并基于线
粒体蛋白质编码基因构建了雁形目 ８ 个物种的系统进化树 ，以期为建昌鸭的起源进化研究及种质资源保护
和合理利用提供资料 ．
１ 材料与方法
１畅 １ 材 料
建昌鸭血样由中国农业科学院家禽所提供 ，随机抽取 １ 份为实验材料 ．其它物种线粒体基因组全序列
皆来自 ＧｅｎＢａｎｋ ，序列登录号见表 １ ．
１畅 ２ 总 ＤＮＡ 的提取
酚氯仿（北京鼎国）抽提法 ，０畅７％ 琼脂糖凝胶电泳检测 ．
１畅 ３ 引物设计和 ＰＣＲ 扩增
根据红头潜鸭 ｍｔＤＮＡ 序列
［９］
设计引物 １５ 对（表 ２） ，由上海生工合成 ．ＰＣＲ 扩增反应总体积为 ２５
μ
Ｌ ：模
①
收稿日期 ： ２００９ ０１ １０
基金项目 ： 国家自然科学基金资助项目 （３０２２１００５） ；国家重点基础研究发展计划（２００６ＣＢ２００１００） ．
作者简介 ： 涂剑锋 （１９８０ ） ，男 ，江西靖安人 ，硕士 ，助理研究员 ，主要从事动物遗传育种研究 ．
资源评论
