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线粒体16SrRNA和COI基因序列比较分析* (2010年)
线粒体16SrRNA和COI基因序列比较分析* (2010年)
自然科学
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对采自莱州湾和胶州湾的日本
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三疣梭子蟹4个野生群体线粒体16SrRNA和CO工基因片段的比较分析* (2010年)
浏览:165
对分别采自辽东湾、莱州湾、海州湾和舟山的三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)4个野生群体的线粒体16SrRNA和COI基因片段进行了扩增和测序,分别得到长度为524bp和658bp的片段。2段序列的碱基组成均显示较高的A+T比例(16S rRNA基因70.8%,COI基因63%),这与果蝇、虾类、蟹类等无脊椎动物的16SrRNA和CO工基因片段研究结果相似。通过对三疣梭子
建昌鸭线粒体基因组全序列分析 (2010年)
浏览:167
参照近源物种线粒体基因组序列设计引物15对,用PCR产物直接测序法测得建昌鸭(Anasplatyrhychos)线粒体基因组全序列,初步分析其特点和各基因的定位。结果显示:建昌鸭线粒体基因组全长16606bp,碱基A、T、G、C的含量分别为29.21%、22.19%、15.77%、32.83%,包含13个蛋白质编码基因、2个rRNA基因、22个tRNA基因和1个非编码调控区(D-loop),基因组
基于线粒体16S rRNA与COI基因序列的刻肋海胆属系统发育研究 (2012年)
浏览:114
本研究以16SrRNA和细胞色素氧化酶I(Cytochrome oxidase subunit I,COI)基因片段序列为标记,以杂色角孔海胆(Salmacis sphaeroides)为外群,基于距离法(NJ)、最大简约法(MP)和最大似然法(ML)分别构建分子系统树,对刻肋海胆属(Temnopleurus)进行了系统发育学研究。结果表明,哈氏刻肋海胆、细雕刻肋海胆、T. alexandri三者
从COI基因序列探讨叶甲科部分昆虫的系统关系 (2010年)
浏览:17
对叶甲科21种昆虫的COI基因(长度为716 bp)的序列组成和变异情况进行了分析。结果表明,21种叶甲碱基T、C、A、G的平均含量分别为39.5%、13.9%、32.1%和14.5%,A+T含量明显高于G+C含量,密码子第三位点A+T平均含量高达90.4%;该序列片段中共有315个碱基发生变异,变异率达到44%;核苷酸替换主要发生在C←→T和A←→T之间,第三位点的替换频率显著高于前两个位点。以
基于线粒体COI基因部分序列分析4种松毛虫的亲缘关系 (2011年)
浏览:98
为了探讨4种松毛虫的亲缘关系,对马尾松毛虫、油松毛虫、赤松毛虫和落叶松毛虫的线粒体COI基因序列进行了扩增和测序。在获得的636bp的COI序列中碱基的平均频率为:A=34.75%,T/U=34.75%,C=15.25%,G=15.25%。马尾松毛虫遗传多样性最高(核酸多样度为3.93%),落叶松毛虫最低(0.629%).4种松毛虫间的亲缘关系由远到近依次为:落叶松毛虫×赤松毛虫(0.083)、落
泥蚶线粒体COI和16S rRNA基因片段序列研究 (2008年)
浏览:134
采用PCR技术扩增了泥蚶线粒体DNA的COI和16SrRNA基因片段,PCR产物经T载体连接后进行克隆、测序,用MEGAversion3.0软件计算这2个基因片段序列碱基组成。结果显示:COI和16SrRNA基因删除引物序列后分别得到660bp和548...
家兔胚胎胃肠道细菌分离及16SrRNA基因序列分析
浏览:154
家兔胚胎胃肠道细菌分离及16SrRNA基因序列分析,郭海勇,单晓枫,对常规饲养、正常妊娠的家兔胚胎后期胃肠道细菌进行分离,基于分离细菌的生理生化特性、16SrRNA基因序列的同源性比较及系统发育分�
弯弓蚌螨(Unionicola arcuata)线粒体12SrRNA基因的序列分析 (2011年)
浏览:112
用线粒体12SrRNA基因特异性引物,对鄱阳湖地区褶纹冠蚌内弯弓蚌螨的线粒体12SrRNA基因进行PCR扩增和双向测序,经校对拼接后,获得全长为648bp的弯弓蚌螨12SrRNA基因全序列。A、T、G、C 4种碱基的平均含量分别为49.1%...
墨吉对虾 Penaeus merguiensis线粒体16SrRNA基因序列分析 (2002年)
浏览:52
比较墨吉对虾6个群体的线粒体16SrRNA基因约457个碱基对的DNA序列.结果表明这6个群体间的遗传距离(D)在0- 0.008 5之间.未发现广东的3个群体与澳洲或新加坡群体间存在地理群体以上的遗传差异.
赤眼鳟线粒体D-loop和Cyt b基因序列的对比分析 (2012年)
浏览:137
研究了长江和珠江野生赤眼鳟Squaliobarbus curriculus共4个群体24个个体的线粒体控制区(D-loop) 和细胞色素b( Cyt b)基因序列,通过PCR扩增与测序,分别获得了长度为598 bp和752 bp的D-loop和Cyt b 基因片段。分析表明,D-loop序列共定义了18个单倍型,存在34个简约信息位点,67个多态性位点,发生转换40次,颠换15次,插入/缺失14次
中华哲水蚤线粒体DNACO1基因序列分析 (2005年)
浏览:131
采用苯酚一氯仿一异戊醇(25:24:1)提取、异丙醇沉淀、酒精洗涤、TE缓冲液保存方法提取了采自胶州湾青岛海域的中华哲水蚤基因组DNA以相应引物经PCR扩增得到线粒体DNA细胞色素氧化酶I亚基基因(mtCOI)片段;PCR产物采用化学法进行质粒重组(载体pGEM-T Easy Vector)、热休克转化重组质粒至大肠杆菌感受态细胞(JM109)、氨苄LB培养基扩大培养;测序.结果表明,中华哲水蚤线
海葵目4种海葵线粒体cyt b基因的序列分析 (2010年)
浏览:124
采用CTAB法提取浙江沿海海葵目4种海葵的基因组,PCR获取4种海葵的线粒体cyt b基因的部分序列(1Kb左右),经序列比对,并利用邻接法(NJ)和最大简约法(MP)进行了系统发育关系的分析。结果发现,红海葵(Actinia equine)、黄侧花海葵(Anthopleura xanthogrammica)及绿疣海葵(Anthopleura midori)3种海葵与已知的海葵科物种老年细指海葵(
3种柔鱼线粒体基因与核核糖体基因片段序列比较分析 (2013年)
浏览:166
为准确检测柔鱼(Ommastrephes bartramii)、茎柔鱼(Dosidicus gigas)与阿根廷滑柔鱼(Illex argentinus)的种间遗传差异,对线粒体16S rRNA、细胞色素b(Cytb)与编码核糖体大亚基的基因(28S rDNA)片段序列进行测定。经比对获得同源片段序列的长度分别为444、430、464 bp,其中16S rRNA 与28S rDNA 基因片段上分别
6个地理种群铜锈环棱螺(Bellamya aeruginosa)线粒体COI基因片段序列分析
浏览:81
6个地理种群铜锈环棱螺(Bellamya aeruginosa)线粒体COI基因片段序列分析,熊红娇,顾钱洪,本实验对来自湖北武汉市南湖,湖北咸宁阳武干渠,湖北鄂州池塘,江西南昌青岚湖,安徽巢湖,江苏宜兴太湖6个地理种群的铜锈环棱�
何首乌的18SrRNA基因序列分析* (2008年)
浏览:140
为探讨野生和种植品种物种间的亲缘关系并为其鉴别提供分子依据,分析了不同产地野生何首乌Polygonum multiflorum Thunb及种植品种和伪品芭蕉的核基因组18S rRNA序列.何首乌的18S rRNA基因序列长度为1809 bp,且高度...
16S rRNA序列分析技术在微生物宏基因组中的应用
浏览:126
16S rRNA序列分析技术在微生物宏基因组中的应用,刘文俊,张春林,本文对近几年来广泛应用于微生物分类、鉴定等研究领域的宏基因组技术进行了综述,尤其对基于16S rRNA基因序列分析等分子标记技术如�
16SrRNA基因序列分析技术在细菌分类中应用的研究进展 (2008年)
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由于16SrRNA基因序列的保守性和存在的普遍性,应用16SrRNA作为分子指标已逐渐成为微生物检测和分类鉴定的一种强有力工具。文章就该基因的特征、研究方法、检测方法及临床应用与研究的新进展等作以简要综述,同时对存在...
基于线粒体DNA的12SrRNA基因序列推断中国及北美部分滑蜥属物种的生物地理和亲缘关系 (2013年)
浏览:145
本文通过线粒体DNA(mtDNA)12SrRNA基因序列分析,证明北美的滑蜥属Scincella(Squamata:Scincidae)物种Sc.late-ralis与中国的滑蜥属南滑蜥种组呈现典型的格雷分布.南滑蜥种组包括宁波滑蜥Sc.modesta,秦岭滑蜥Sc....
海带配子体18S rRNA基因的克隆、序列分析及其作为内参基因的应用
浏览:38
海带配子体18S rRNA基因的克隆、序列分析及其作为内参基因的应用,周志刚,毕燕会,通过基因克隆和序列测定,获得了海带(Laminaria japonica)配子体的18S rRNA基因序列,其长度为1716 bp, GenBank登录号为EU...
虫纹鳕鲈线粒体COI基因片段的克隆与序列分析 (2012年)
浏览:10
对虫纹鳕鲈(Maccullochella peelii)线粒体DNA细胞色素氧化酶I亚基(cytochrome oxidase subunit I,COI)基因进行了扩增、克隆和测序,并对COI序列进行了分析。结果显示,澳洲虫纹鳕鲈COI基因序列长度为652bp,A、C、T、G4种碱基平均比例分别为25.3%、16.6%、32.9%、25.2%,A+ T比例(58.2%)明显高于G+C (41.8
渤海湾口虾蛄线粒体COI基因的遗传多样性研究 (2010年)
浏览:131
口虾蛄(Oratosquilla oratoria)是我国沿海重要的渔业种,本文对渤海湾口虾蛄COI基因的遗传多样性进行研究,在48条633 bp的COI序列中,存在19个变异位点,且转换高于颠换;不同水域间的平均遗传距离为0.0049,单元型HP3、HP5、HP14是渤海湾不同水域的共享单元型,且HP5和HP17是渤海湾较为原始的类型,并且歧点分布分析显示渤海湾口虾蛄种群经历过快速扩张过程.本研
松毛虫属部分地理种群COI基因序列分析1) (2010年)
浏览:83
为了寻求松毛虫属昆虫分类的新方法,利用COI基因为分子标记针对松毛虫属(Dendromilus)10个地理种群的昆虫进行了分子系统学的研究。结果表明,COI序列中,共有248个变异位点、219个简约信息位点,A+T平均含量为71.5%,大部分碱基改变为颠换。不同地理种群松毛虫的遗传距离为0.007~0.319,平均遗传距离为0.175。利用邻接法(NJ)、最大简约法(MP)、最小进化法(ME)构建
池蝶蚌(Hyriopsis Schlegelii)线粒体DNA COII基因的序列分析 (2010年)
浏览:19
用细胞色素氧化酶II基因特异性引物,对人工选育后的F3代池蝶蚌的线粒体细胞色素氧化酶II基因进行PCR扩增和双向测序,在10个个体中均得到序列一致的细胞色素氧化酶II基因序列,长度为681bp;A、T、G、C含量分别为19.4%(132个)、30.4%(207个)、38.9%(265个)和11.3%(77个),A+T含量(58.3%)明显高于G+C(41.7%)含量,与其它淡水珠蚌科种类相同基因片
DNA芯片快速检测淋球菌16SrRNA基因突变.pdf
浏览:141
DNA芯片快速检测淋球菌16SrRNA基因突变.pdf
麂属(Muntiacus)动物12SrRNA基因序列分析及其分子进化关系 (2002年)
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crinifrons)(2n=8♀,9♂)线粒体DNA 12SrRNA基因450bp左右的片段进行序列分析,并根据序列信息建立分子类聚图。同时探讨了这3种动物的起源、分类地位及进化关系。结果表明黑麂起源最早,赤麂次之,小麂最晚。
微生物组16SrRNA数据分析.pdf
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微⽣物组16SrRNA数据分析 微⽣物组16sRNA 数据分析常规流程:划分OTU , 构造距离矩阵,分析物种多样性指数,构建序列的进化树及物种注释信息。 可以使⽤USEARCH、VSearch、Qiime来进⾏分析。 1、划分OTU OTU为操作...
江西7种蛇类基于16 SrRNA基因的DNA条形码构建 (2011年)
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采用新设计COI、16S、CR3种线粒体基因(位点)的简并引物,对江西地区常见蛇类(2科6属7种)共20个个体样本进行了DNA条形码分析的初步尝试,将实验结果结合GenBank部分蛇类序列数据分析表明,在本实验涉及的蛇类个体及类群...
16SrDNA序列对细菌进行系统发育树
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音视频-编解码-鲍曼不动杆菌16SrRNA甲基化酶编码基因分布研究.pdf
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