defining_genomic_regions:定义基因组中的区域

定义基因组区域 参考基因组只是一串 A、C、G 和 T。 然而，基因组中有许多功能元件，并且已经进行了大量的努力来注释基因组。 任务是对人类和小鼠基因组中的基因和基因变异进行编目。 协调并提供拟南芥的基因组注释。 通常，基因组注释在中提供。 我们将使用和 GTF 文件定义参考基因组中的区域。 上面的 IGV 屏幕截图显示了深蓝色的各种基因模型、浅红色的外显子区域、浅绿色的内含子区域和浅蓝色的基因间区域。 安装 BEDTools 要开始，请下载并编译 BEDTools（如果您还没有的话）。 git clone https://github.com/arq5x/bedtools2.git cd bedtools2 make clean && make all 或者，您可以使用安装 BEDTools。 conda install -c bioconda bedtools 下载 GTF