fgwas:功能基因组学和全基因组关联研究

fgwas fgwas是用于将功能基因组信息整合到全基因组关联研究（GWAS）中的命令行工具。 基本设置如下：您已经执行了GWAS或许多GWAS的荟萃分析，并确定了数十个影响疾病或性状的基因座（如果至少有20个独立的p-位点，我们的方法效果最好。值小于5e-8）。 我们着手解决以下问题： 这些关联是否在基因组的特定区域类型（编码外显子，DNAse超敏位点等）中得到了丰富？ 我们是否可以使用这些扩增（如果存在）来鉴定影响该性状的新基因座？ 基本模型在以下文章中进行了描述：Pickrell JK（2014）。 bioRxiv 10.1101 / 000752 本文中使用的注释可。 ＃＃安装＃＃ ### Dependencies ### fg取决于： ###快速入门###最新版本是：版本0.3.6。 请参阅上面的 。 在以上链接中下载了fgwas-0.3.3.tar.gz之后，运行