关联分析matlab代码-fractalgenetics:心肌小梁的基因组结构和功能作用分析

关联分析matlab代码 心脏分形结构的遗传和功能洞察力 成年人类心脏的心内膜表面由肌肉小梁的复杂网络组成。 被认为是胚胎发育的残余物，为何这些复杂的结构仍在成年器官中持续存在仍然是未知的。 在这里，我们使用人群基因组学，基于图像的中间表型和计算机模拟来确定这种复杂的心血管特征对功能的影响。 以下存储库包含研究中应用的所有数据分析和处理脚本。 软件需求 数据处理和分析被嵌入到不同的（v5.1.5）工作流程中。 遗传学分析需要plink和。 数据可视化和处理在3.6.1版中完成。 遗传关联测试需要v1.3。 分形分析需要Matlab和。 用有限元建模。 内容 1。 使用预先存在的图像分割来确定心肌内的目标区域，从而对分割的心脏图像进行自动分形分析。 2。 分形分析结果的后处理代码，包括将FD值插值到个体之间相同数量的切片，每个个体FD值的摘要统计信息以及用于心肌和小梁轮廓共配准的功能集合。 3。 UK Biobank中的小梁GWAS包含用于发现和复制研究的基因型和表型处理，GWAS，GWAS结果处理，功能富集，孟德尔随机化分析和LDhub分析的分析管道。 4， 英国数字心脏计划队列（第二