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关联分析matlab代码张量组成分析(TCA) 张量组成分析(TCA)允许将来自混合源的二维数据(通过观察得到的特征)反卷积为信号的三维矩阵(通过通过观察得到的特征)。 TCA还可以在对特定于源的影响进行建模(TCA回归)时,针对感兴趣的结果测试数据中具有不同统计关系的特征; 特别是,它允许查找特定于源的信号与结果之间的统计关系。 在DNA甲基化数据的背景下,TCA可以将每个个体的组织水平总体甲基化(个体的甲基化位点)分解为张量的细胞类型特异性甲基化水平的张量(个体个体的甲基化位点按细胞类型),并允许检测具有特定结果的特定细胞类型的关系(关联)。 有关更多详细信息,请参见Rahmani等。 (2019) 。 R和Matlab均提供TCA。 请注意,在描述TCA的出版物中使用了Matlab版本来得出结果。 。 R版 TCA的R软件包可在CRAN上获得。 在R中运行以下命令以安装TCA: install.packages( " TCA " ) 可以找到TCA R软件包的手册。 您还可以在R中使用TCA找到有关细胞类型特定的分辨率表观遗传学的TCA的完整工作示例。 Matlab版本 TCA的
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