rnaflow:使用Nextflow的简单RNA-Seq差异基因表达管道
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2021-04-29
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rnaflow-master 
.gitignore 2KB nextflow.config 5KB bin improve_deseq_table.rb 974B deseq2.R 34KB refactor_reportingtools_table.rb 11KB assets regionReport_DESeq2Exploration_custom.Rmd 15KB multiqc_config.yaml 1KB test-data hsa 
SRR3670985_sub.fastq.gz 5.62MB SRR3670986_sub.fastq.gz 5.63MB README.md 749B SRR3670978_sub.fastq.gz 5.64MB SRR3670977_sub.fastq.gz 5.63MB
execution_report.html 2.87MB input.se.hsa_small.csv 249B LICENSE 34KB .github workflows nextflow-test.yml 221B main.nf 36KB README.md 27KB configs nodes.config 689B container.config 1KB conda.config 1KB local.config 584B figures 
tower.png 69KB
workflow.jpg 911KB logo.png 162KB chart.png 360KB modules tpm_filter.nf 3KB stringtie.nf 4KB referenceGet.nf 2KB deseq2.nf 2KB multiqc.nf 2KB busco.nf 2KB sortmernaGet.nf 2KB featurecounts.nf 1KB dammitGetDB.nf 2KB prepare_annotation.nf 4KB hisat2.nf 2KB annotationGet.nf 2KB trinity.nf 3KB fastqc.nf 389B sortmerna.nf 3KB fastp.nf 1KB buscoGetDB.nf 536B utils.nf 136B dammit.nf 1KB get_test_data.nf 2KB envs subread.yaml 68B multiqc.yaml 82B trinity.yaml 70B python3.yaml 103B deseq2.yaml 601B stringtie.yaml 92B dammit.yaml 93B busco.yaml 81B basic_tools.yaml 74B fastqc.yaml 84B fastp.yaml 65B sortmerna.yaml 102B hisat2.yaml 83B citations.md 8KB资源评论
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