deepvariant：Google的DeepVariant变体调用方作为Nextflow管道

nf-core / deepvariant 深度变体作为Nextflow管道 用于运行Nextflow管道。 什么是DeepVariant，为什么在Nextflow中使用？ Google Brain团队于2017年12月发布了基于DeepLearning：DeepVariant的 。 实际上，DeepVariant首先基于BAM文件构建图像，然后使用DeepLearning图像识别方法来获取变体，并最终将预测的输出转换为标准VCF格式。 DeepVariant作为Nextflow管道为用户提供了多个优势。 它通过预处理步骤自动处理一些额外需要的索引和压缩文件的创建，这些文件是DeepVariant的必要输入，通常应由用户手动生成。 可以同时对多个BAM文件执行变体调用，并且由于Nextflow的内部并行化，不会浪费资源。 Nextflow对Docker的支持允许通过在Docker容器内部运行每个步骤，以一种可计算的，可重复的和干净的方式生成结果。 有关Google DeepVariant的更多详细信息，请参阅或此。 有关Nextflow中DeepVariant的更多信息，请