等位基因频率

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等位基因频率

: HAFpipe-line:计算池序列样本的单倍型衍生等位基因频率 HAF管道是一种基于bash和R的管道，可根据库序列数据和创建者SNP配置文件计算单倍型推断的等位基因频率。纸 Tilk，S.，Bergland，A.，Goodman，A.，Schmidt，P.，Petrov，D.，＆Greenblum，S.（2019年）。在进化和...
评级：0 浏览量：188 收藏量：1 资源大小：6.64MB 上传时间：2021-04-10

: BAG_SNPs:使用基于SNP的野生物种种群的等位基因频率和遗传多样性估算种质库（BAG）样本量的脚本使用SNP和重采样数据集的种子/种质库中的等位基因频率和遗传多样性使用等位基因频率和野生物种/种群的遗传多样性估算种质/种子库（BAG）中样本量的影响的脚本番薯分三步走：使用VCF计算野生物种/种群中的等位基因...
评级：0 浏览量：329 收藏量：0 资源大小：24KB 上传时间：2021-03-08

: snpexp:带 BAM 文件和 VCF 文件的等位基因频率计数器 SnpExp 的自述文件介绍SnpExp 是一个等位基因频率计数器，带有 BAM 文件和 VCF 文件。安装在构建这个项目之前，你必须安装 Li 等人提供的 libbam。（）。如果构建 SAMtools bam.h，目录中将出现 bgzf.h 和 libbam...
评级：0 浏览量：256 收藏量：0 资源大小：2.06MB 上传时间：2021-06-12

: GeTallele:GeTallele-一个工具箱，提供了一组用于分析，统计评估和可视化基因组和转录组等位基因频率 GeTallele：分析DNA和RNA等位基因频率分布的方法”中进行了描述。可在以下位置获得开放获取文件 GeTallele描述功能性其提供了一套用于分析，统计评估和可视化锗诺姆和T ranscriptome等位基因频率分布的函数的工具...
评级：0 浏览量：89 收藏量：0 资源大小：4.16MB 上传时间：2021-05-23

: CNAplot：基于测序读数和变异等位基因频率检测癌症中染色体拷贝数改变的软件
评级：0 浏览量：27 收藏量：0 资源大小：0B 上传时间：2024-01-26

: simsfs_fast:使用预先计算的等位基因频率表在简单的群体遗传模型下模拟站点频谱（SFS）该程序将预先计算的表格用于DFE-alpha生成的等位基因频率向量，以加快计算速度。转到此处下载表格： : 。需要一个directory_config.dat文本文件，用于指定这些表的目录。引文如果您使用此软件为出版物生成数据，...
评级：0 浏览量：276 收藏量：0 资源大小：45KB 上传时间：2021-04-23

: freqseq:用于计算 BAM 文件中“读取等位基因”频率的简单工具该程序编写了一项特定任务（从 NGS 数据中检测多种感染），因此许多有趣的参数（次要等位基因频率截止、映射和碱基质量截止）都是当前硬编码的（尽管这可以很容易地更改） . ＃＃建造构建由 cmake 管理。这一系列...
评级：0 浏览量：250 收藏量：0 资源大小：1.94MB 上传时间：2021-07-23

: ABC:来自 Chip-seq 的等位基因特异性结合如果您有基因组序列数据，您可以使用 DNA 中的等位基因比率作为预期频率来控制染色体拷贝数。警告在选择 SNV 时应谨慎。重复中的纯合SNV或SNV似乎具有很强的等位基因特异性作用。建议您在运行 ABC 之前过滤 ...
评级：0 浏览量：114 收藏量：0 资源大小：13KB 上传时间：2021-05-31

: epialleleR:快速，可感知等位基因的甲基化报告基因-RBioc软件包 epialleleR是一种R软件包，用于使用二进制比对图（BAM）文件作为输入来调用下一代测序数据中基因组区域或单个胞嘧啶的甲基化超等位基因频率。其他功能包括计算每次读取的β值的经验累积分布函数，并测试等位基因甲...
评级：0 浏览量：102 收藏量：0 资源大小：1.68MB 上传时间：2021-04-07

: kras-allele-genetic-interactions:KRAS等位基因的等位基因和组织特异性相互作用的遗传研究 KRAS突变的起源和遗传相互作用是等位基因和组织特异性的约书亚·库克（Joshua H.... 但是，许多等位基因的观测频率和预测频率之间存在实质性差异，这表明生物学选择是突变等位基因的组织特异性频率的基础。与已
评级：0 浏览量：87 收藏量：0 资源大小：385.28MB 上传时间：2021-05-09

: 有关基因频率题目的解法.ppt 基因频率是生物进化和遗传学中的关键概念，它表示某个特定基因在种群所有等位基因中的比例。在种群中，基因频率是衡量基因变异和遗传多样性的重要指标。本篇将详细介绍如何根据不同的信息来源计算基因频率，并通过...
评级：0 浏览量：8 收藏量：0 资源大小：44KB 上传时间：2021-12-23

: 基因频率计算规律总结.doc 基因频率是指在一个种群中，某个特定等位基因出现的比率。在这个例子中，我们关注的是人类的红绿色盲基因（Xb）和正常基因（XB）。通过分析男性中色盲的概率，我们可以推算出基因频率。例2中提到，男性色盲的概率...
评级：0 浏览量：45 收藏量：0 资源大小：103KB 上传时间：2021-09-26

: 8、基因频率和基因型频率的计算.pdf 1. **基因频率**是指在种群中某个等位基因出现的比率。在给定的基因型频率下，基因频率可以通过以下方式计算： - 对于纯合子和杂合子都已知的情况，基因频率A% = AA% + 1/2Aa%，a% = aa% + 1/2Aa%。 - 如果种群...
评级：0 浏览量：87 收藏量：0 资源大小：53KB 上传时间：2021-10-07

: 基因表达信息化随着分子生物学技术的进步，对HNA系统的分子基础及其等位基因频率的研究变得越来越重要。了解不同人群中的HNA等位基因频率有助于深入理解遗传多样性对健康和疾病的影响。 #### 研究对象与方法本研究选取了来自...
评级：0 浏览量：49 收藏量：0 资源大小：253KB 上传时间：2015-06-28

: 2016届高考生物一轮复习种群基因频率与基因型频率小题对点练 1. **基因频率**：在种群中，一个特定基因出现的频率是指该基因在所有等位基因中的比例。例如，如果B基因型的个体占40%，b基因型占10%，那么B基因频率是(40%+10%) / 2 = 55%，b基因频率是(10% + 50%) / 2 = 30%。 2...
评级：0 浏览量：37 收藏量：0 资源大小：95KB 上传时间：2021-08-19

: 培优讲堂(六)——种群基因频率与基因型频率的计算题型归纳.pdf 在种群中，基因频率是指某个特定基因在所有等位基因中所占的比例，而基因型频率则是某种特定基因型个体在种群中出现的比率。在题型归纳中，我们可以看到几个具体的计算实例： 1. 题目1展示了如何根据种群中不同...
评级：0 浏览量：57 收藏量：0 资源大小：15KB 上传时间：2021-10-29

: 论文研究 - 基因型分析显示孟加拉国类风湿关节炎患者HLA等位基因与临床参数相关这项研究调查了孟加拉人群中34名健康对照者和57名类风湿关节炎（RA）患者中HLA等位基因（HLADRB1 * 01，* 03，* 04，* 07，HLA-DQB1 * 0201，* 0301/4）的分布，并相关具有临床参数的基因型频率。在RA中，HLA-DRB1 ...
评级：0 浏览量：184 收藏量：0 资源大小：1.39MB 上传时间：2020-05-17

: powermaker 说明书 PowerMarker支持的数据类型包括DNA序列数据、等位基因频率数据、距离矩阵数据、系统发育树数据以及表格数据。软件运行在Windows操作系统平台，用户可以通过邮件或官方网址获取帮助和支持。 PowerMarker的主要功能...
评级：0 浏览量：814 收藏量：0 资源大小：254KB 上传时间：2014-12-15

: 江苏省启东市高中生物种群基因频率的改变与生物进化课时训练新人教版必修2 基因频率是指在种群基因库中，某个特定基因占所有等位基因的比例。例如，在一个种群中，如果A基因的数量为90，a基因的数量为110，则A基因的频率为0.45，a基因的频率为0.55。基因频率的变化反映了种群的遗传组成变化...
评级：0 浏览量：41 收藏量：0 资源大小：175KB 上传时间：2021-08-05

: autoLM：使用空间自校正的快速基因-环境关联测试自动LM 使用空间自校正的基因-环境关联测试概括autoLM确定等位基因频率与环境指标之间的相关性。它将使用简单的线性回归来确定最强的GEA相关性。如果包括遗传簇和种群坐标，autoLM将使用空间自相关和种群结构作为...
评级：0 浏览量：55 收藏量：0 资源大小：6KB 上传时间：2021-02-14

: 全国通用2016高考生物二轮专题复习体系通关2高频考点3变异育种与进化含基因频率计算试题 1. **基因频率计算**：在生物进化和遗传学中，基因频率是指在一个种群中某个基因占所有等位基因总数的比例。在水稻育种中，通过基因频率的计算，可以评估基因在种群中的变化，进而预测物种的进化趋势。例如，在杂交...
评级：0 浏览量：48 收藏量：0 资源大小：156KB 上传时间：2021-08-18

: Science比较基因组揭示银边鱼应对捕鱼行为的表型进化机制1 通过对比基因组，研究人员注意到在实验品系中，等位基因频率显著变化的SNP主要集中在四个不同大小的染色体上，尤其在24号染色体上，有9348个SNP涉及415个基因，这些基因与肌肉收缩、钙固定和储存相关，表明了与体型...
评级：0 浏览量：38 收藏量：0 资源大小：576KB 上传时间：2022-08-08

: 2019_2020学年高中生物第7章现代生物进化理论第2节一种群基因频率的改变与生物进化练习新人教版必修2 2. **基因频率的计算**：在种群中，某一个基因的频率等于该基因所有等位基因总数除以等位基因的总数。例如，如果在一个种群中，基因型AA的个体占24%，Aa占72%，aa占4%，那么基因A的频率是(24% + 72% / 2) = 60%，...
评级：0 浏览量：39 收藏量：0 资源大小：2.44MB 上传时间：2021-09-09

: 论文研究 - 成本有效发现使用池序列的同素多倍体物种的核苷酸多态性。对于两个位点，我们使用读取数估算了等位基因频率，然后通过进行基于个体的估算来验证这些估算。使用我们的生物信息流水线的Pool-Seq可以有效评估许多个体中的核苷酸多态性，即使在同种多倍体物种中也是如此。
评级：0 浏览量：80 收藏量：0 资源大小：1.06MB 上传时间：2020-06-02

: 2020_2021学年高中生物第7章现代生物进化理论第2节第1课时种群基因频率的改变与生物进化学案新人教版必修... 7. **基因频率和基因型频率的计算**：基因频率的计算公式为：某基因频率=（该基因总数/（该基因总数+其等位基因总数））×100%。通过分析基因型频率的变化，可以推断出种群的进化趋势。通过以上知识点的学习，学生...
评级：0 浏览量：38 收藏量：0 资源大小：277KB 上传时间：2021-08-07

: 肿瘤基因检测的解读流程.doc 在临床解读过程中，还需要考虑人群种群遗传差异，如1000 Genomes项目和Exome Aggregation Consortium (ExAC)数据库提供的等位基因频率信息，这有助于判断变异是否为罕见或常见变异，对疾病的潜在影响有多大。...
评级：0 浏览量：35 收藏量：0 资源大小：153KB 上传时间：2021-09-29

: 音视频-编解码-1.上皮钙粘素基因CDH1编码区多个SNP和Exon 通过对实验组（膀胱移行细胞癌患者）和对照组（健康人）的对比分析，发现实验组在-160处的A等位基因频率和Exon-13的154处T等位基因频率显著高于对照组。进一步的统计分析显示，A等位基因的高频率与浸润性膀胱癌的...
评级：0 浏览量：43 收藏量：0 资源大小：3.99MB 上传时间：2022-04-16

: 基因芯片联合检测妊娠高血压综合征相关基因的多态性.pdf 研究结果显示，MTHFR、eNOS、ACE的基因型、基因频率、等位基因频率与PIH的发生存在相关性，而AGT基因多态性则与PIH无统计学上的显著差异。从技术层面讲，基因芯片联合检测技术以其高通量和高效性，特别适合用于...
评级：0 浏览量：46 收藏量：0 资源大小：268KB 上传时间：2021-07-26

: 基于核基因组标记的群体遗传学研究中的数学分析方法 (2011年) ### 基于核基因组标记的群体遗传学研究中的数学分析方法 ...此外，随着显性分子标记中隐性等位基因频率估算方法的研究进展，以及群体遗传学分析软件的不断发展，未来的群体遗传学研究将会更加精确和高效。
评级：0 浏览量：66 收藏量：0 资源大小：933KB 上传时间：2021-05-25

: 论文研究 - 儿童血清素转运蛋白启动子基因多态性与PTSD的相关性应用病例对照关联分析法，通过聚合酶链反应（PCR）检测5-HTTLPR基因多态性和扩增片段长度多态性，分析基因型和等位基因频率。结果：海南汉族儿童创伤后应激障碍组有4、14和32例LL，SL和SS，对照组有13、20和17例。...
评级：0 浏览量：117 收藏量：0 资源大小：308KB 上传时间：2020-05-21

: 论文研究 - 内皮型一氧化氮合酶（eNOS）Glu298Asp基因多态性（G894T）是突尼斯人口中2型糖尿病的危险因素在我们的系列中，我们没有发现有或没有退行性并发症的糖尿病患者在基因型或等位基因频率上有任何显着差异。结论：eNOS基因的G894T多态性似乎是T2DM的危险因素。他在退行性并发症发展中的作用仍然得到证明。
评级：0 浏览量：96 收藏量：0 资源大小：253KB 上传时间：2020-05-30

: 拟南芥突变基因位置的Linux大数据分析.pdf 接下来，文章提到了样品百分数△d的计算，这是一种统计方法，通过在野生型和突变型DNA池中使用滑动窗口来分析等位基因频率的差异。通过对这些差异进行显著性分析，研究者能够识别出可能与突变相关的区域。在数据...
评级：1 浏览量：94 收藏量：0 资源大小：1.04MB 上传时间：2021-09-06

: Real-time PCR、焦磷酸测序及基因芯片快速检测ALDH2＊ 2基因多态性.pdf 对比其他种族，中国人群的ALDH2*2等位基因频率显著高于欧洲和美洲人群，并与其他亚洲人群存在统计学差异。这些发现对于理解不同种族酒精代谢能力的遗传基础以及饮酒行为的遗传影响具有重要意义。综上所述，实时PCR...
评级：0 浏览量：65 收藏量：0 资源大小：1.39MB 上传时间：2021-07-26

: 全基因组重测序数据分析报告.doc 统计 SNV 的等位基因频率在全基因组上的分布稀有等位基因数目在不同类别的 SNV 中的比率分布（a）； SNV 的类别主要考虑：（1）无义（nonsense）,（2）化学结构中非同义，（3）所有非同义，（4）保守的非同义，（5）...
评级：5 浏览量：317 收藏量：1 资源大小：1.03MB 上传时间：2021-09-26

: FADS基因簇SNP与冠心病的易感性研究.pdf 通过这项技术，研究人员分析了冠心病患者组（375例）与对照组（389例）的等位基因频率，并对所有SNP位点进行了连锁不平衡分析。研究结果显示，在冠心病组与对照组之间，rs174537、rs174460和rs174611这三个SNP位点...
评级：0 浏览量：75 收藏量：0 资源大小：235KB 上传时间：2021-08-04

: 等位酶技术在植物中的应用 (2001年) 通过比较不同种群或种之间等位基因的频率，可以测量和了解它们之间遗传学上的相似性和差异性。这种测量对于分析种群的亲缘关系、分化过程以及生态地理分布特征等具有重要意义。 3. 植物系统发育研究：等位酶技术...
评级：0 浏览量：47 收藏量：0 资源大小：355KB 上传时间：2021-06-15

: 网络技术-网络基础-EOPD相关基因的研究MAOB和COMT.pdf 通过聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）技术，研究人员分析了不同群体中MAO-B基因型和等位基因的分布，结果显示EOPD患者的特定基因型和等位基因频率显著增加，表明它们可能是发病的危险因素。...
评级：0 浏览量：48 收藏量：0 资源大小：5.52MB 上传时间：2022-04-18

: CLImAT:使用全基因组测序数据准确检测不纯和非整倍体肿瘤样本中的拷贝数改变和杂合性丢失 CLImAT 无需匹配的正常样本，即可对来自测序肿瘤样本的读数计数和等位基因频率进行综合分析，并提供广泛的数据处理程序，包括读数计数的 GC 含量和可映射性校正以及 B 等位基因频率的分位数归一化。即使对于具有非...
评级：0 浏览量：121 收藏量：0 资源大小：511KB 上传时间：2021-06-03

: 网络技术-网络基础-COMT、5-HT2A、ApoE及CYP2D6基因多态性与难治性精神分裂症的关联研究.pdf 此外，家族史阳性的精神分裂症患者中，£4等位基因频率较高，而83等位基因和3/3基因型可能具有保护作用。第四部分关注了CYP2D6基因多态性与难治性精神分裂症的关联。研究方法同样采用了聚合酶链反应和限制性片断...
评级：0 浏览量：42 收藏量：0 资源大小：5.41MB 上传时间：2022-04-18

: 论文研究 - 5-HTTLPR遗传多态性与创伤后应激障碍的相关研究使用各种统计方法对基因型和等位基因频率分布进行分析和比较。发现患者LL，SL和SS基因型的频率分别为5、16和36，而健康对照者为16、22和19。倾向于L基因型的患者（22.8％）比对照组（47.4％）少，但是具有S基因型...
评级：0 浏览量：100 收藏量：0 资源大小：410KB 上传时间：2020-05-23

: 网络技术-网络基础-EOPD相关基因的研究MAO-B和COMT.pdf 研究方法采用了聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）技术，分析了EOPD、晚发帕金森病（Late-Onset Parkinson's Disease, LOPD）患者和健康对照者的MAO-B基因型和等位基因频率。结果表明，EOPD组的A/A基因...
评级：0 浏览量：34 收藏量：0 资源大小：5.52MB 上传时间：2022-04-18

: dd护骨素基因启动子区TC单核苷酸点突变多态性与.pptx 然而，当比较汉族妇女与高加索人种的妇女时，发现T950-C基因型和等位基因频率存在显著差异，这表明不同种族间可能存在遗传差异，影响OPG基因的表达和骨质疏松症的风险。进一步的研究还发现，OPG基因启动子区的TC单...
评级：0 浏览量：34 收藏量：0 资源大小：115KB 上传时间：2021-11-29

: 不同基因辅助选择方法对QTL的选择效率 (2012年) 在假定目标性状由一个QTL和多基因...结果表明:与常规动物模型BLUP相比,GTS和GBLUP选择均可获得更大的QTL基因型值进展,QTL增效等位基因频率上升的速度也更快;与GBLUP相比,GTS方法对QTL的选择效率更高。GTS和GBLUP对QTL
评级：0 浏览量：73 收藏量：0 资源大小：1012KB 上传时间：2021-06-05

: 论文研究 - 东北汉族人群抵抗素420C / G多态性与2型糖尿病大血管病变的相关性分析结果：与ND组相比，T2DM并发大血管病变组的等位基因频率和简单的CC / GC + GG基因型差异有统计学意义（P <0.01）。 T2DM合并大血管病变组的等位基因频率和CC / GC + GG基因型与T2DM组相比有显着性差异（P <...
评级：0 浏览量：120 收藏量：0 资源大小：347KB 上传时间：2020-05-31

: Principles-population-genetics-ten-Kate-2010 种群遗传学是研究在种群中基因型和等位基因频率分布的学科，以及这些分布的决定因素和可能的变化趋势。Leo P ten Kate教授在2010年日内瓦的性与生殖健康研究培训课程中阐述了这一主题。本文将深入探讨种群遗传学的...
评级：0 浏览量：34 收藏量：0 资源大小：495KB 上传时间：2023-04-05

: VerifyBamID:VerifyBamID2 与特定人群的等位基因频率相比，使用合并的等位基因频率时，我们观察到CEU，YRI，FIN和CHS人群的污染水平分别低估了20％，40％，51％和73％。使用我们的新方法，低估偏差减少到了2％至5％。输入文件：对齐的NGS...
评级：0 浏览量：431 收藏量：0 资源大小：58.8MB 上传时间：2021-05-27

: 基于COI基因对混养缅甸蟒个体来源及遗传多样性分析.zip 2. 等位基因频率：观察各等位基因在种群中的分布，以揭示可能的自然选择信号。 3. 遗传分化：测量不同种群间的遗传分化（FST），以评估种群间的遗传隔离程度。 4. 濒危状态：根据遗传多样性和种群大小，评估缅甸蟒的...
评级：0 浏览量：69 收藏量：0 资源大小：400KB 上传时间：2021-10-16

: 微流控芯片对血管紧张素原基因多态性的研究同时，与西藏人群的等位基因频率分布相比，也没有发现显著性差异，这进一步强调了该位点的多态性可能是一个中性标志，而与高血压的关联性不强。该研究首次采用了微流控芯片技术对AGT基因多态性进行研究，并为基因...
评级：0 浏览量：78 收藏量：0 资源大小：683KB 上传时间：2020-01-06

: 山羊Y染色体基因克隆与多态性分析多态性是指在群体内，某一基因或等位基因频率存在两种或两种以上的状态。在SRY基因中检测到6个SNP位点，SNP（单核苷酸多态性）是DNA序列上单个核苷酸差异的一种形式，是分子遗传研究中的一个重要指标。此外，研究...
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