BAG_SNPs:使用基于SNP的野生物种种群的等位基因频率和遗传多样性估算种质库(BAG)样本量的脚本-源码

VIP专享 2021-03-08 03:50:56 24KB ZIP
37
收藏 收藏
举报

使用SNP和重采样数据集的种子/种质库中的等位基因频率和遗传多样性 使用等位基因频率和野生物种/种群的遗传多样性估算种质/种子库(BAG)中样本量的影响的脚本 番薯分三步走: 使用VCF计算野生物种/种群中的等位基因频率 使用野生物种/种群作为模型,使用VCF计算重采样数据集中的等位基因频率。 使用野生物种/种群作为使用GENIND的模型,计算重采样数据集中的遗传多样性。 Pilocarupus分五个步骤: 使用GENIND对象(空等位基因和等位基因> 50个副本)在自然种群和具有不同样本量的重采样种群中计算等位基因频率。 使用GENIND对象在自然种群和具有不同样本量的重采样种群中计算遗传多样性(HE)。 使用GENIND对象在自然种群和具有不同样本量的重采样种群中计算等位基因丰富度(AR)。 使用VCF计算自然种群和具有不同样本量的重采样种群的核苷酸多样性(PI)。 使

...展开详情
立即下载
限时抽奖 低至0.43元/次
身份认证后 购VIP低至7折
一个资源只可评论一次,评论内容不能少于5个字
您会向同学/朋友/同事推荐我们的CSDN下载吗?
谢谢参与!您的真实评价是我们改进的动力~
  • 至尊王者

关注 私信
上传资源赚钱or赚积分
最新推荐
BAG_SNPs:使用基于SNP的野生物种种群的等位基因频率和遗传多样性估算种质库(BAG)样本量的脚本-源码 (VIP专享) VIP下载
1/0