powsimR：功率分析对于优化RNA-seq实验的设计以及评估和比较检测差异表达基因的能力至关重要。 PowsimR是一种灵活...
需积分: 10 191 浏览量
2021-02-05
14:41:52
上传
评论
收藏 10.41MB ZIP 举报
powsimR：功率分析对于优化RNA-seq实验的设计以及评估和比较检测差异表达基因的能力至关重要。 PowsimR是一种灵活的工具，可以模拟和评估来自大量（尤其是单细胞RNA-seq）数据的差异表达，使其适用于先验和后验功率分析 （185个子文件） 
Bioc.bib 21KB CITATION 934B docsearch.css 11KB pkgdown.css 7KB bootstrap-toc.css 2KB anchor-sections.css 205B DESCRIPTION 4KB .gitignore 463B
powsimR.html 2.72MB powsimR.html 2.65MB powsimR.html 87KB index.html 43KB simulateDE.html 32KB Setup.html 23KB estimateParam.html 22KB evaluateDE.html 22KB LICENSE.html 20KB evaluateROC.html 18KB simulateCounts.html 16KB evaluateSim.html 15KB estimateSpike.html 14KB plotEvalDE.html 14KB plotTime.html 14KB evaluateDist.html 14KB plotEvalSim.html 14KB plotEvalROC.html 13KB simulateFlow.html 11KB insilicoNBParam.html 11KB SimSetup.html 11KB index.html 11KB plotParam.html 11KB DESetup.html 11KB GeneCounts.html 10KB index.html 9KB plotSpike.html 9KB plotEvalDist.html 8KB plotCounts.html 8KB SpikeCounts.html 8KB printEvalDE.html 7KB Bulk_Read_Counts.html 7KB SpikeInfo.html 7KB kolodziejczk_simDE.html 6KB scrbseq_gene_cnts.html 6KB kolodziejczk_param.html 6KB kolodziejczk_cnts.html 6KB GeneLengths_mm10.html 6KB smartseq2_gene_cnts.html 6KB GeneLengths_hg19.html 6KB authors.html 6KB smartseq2_spike_info.html 6KB scrbseq_spike_info.html 6KB smartseq2_spike_cnts.html 5KB scrbseq_spike_cnts.html 5KB gene_lengths.html 5KB 404.html 5KB index.html 5KB simeval.jpeg 180KB lfcdist.jpeg 73KB bootstrap-toc.js 5KB pkgdown.js 3KB docsearch.js 2KB anchor-sections.js 1004B empty-anchor.js 653B header-attrs.js 507B README.md 17KB LICENSE.md 9KB NEWS.md 2KB NAMESPACE 8KB
powsimr_workflow.pdf 281KB
paramsplot-1.png 461KB powsimR-vignette-schematic.png 333KB powsimRvignetteschematic.png 247KB powsimRvignetteschematic.png 247KB powsimr_workflow.png 245KB powsimr_workflow.png 245KB logo.png 161KB powsimR.png 161KB spikeplot-1.png 155KB estparam_gene_celseq2.png 137KB estparam_gene_celseq2.png 137KB evalplot2-1.png 127KB lfcdist.png 101KB lfcdist.png 101KB plotthreegrp-1.png 101KB evalrocres_liberal_celseq2.png 100KB evalrocres_liberal_celseq2.png 100KB estparam_spike_celseq2.png 84KB estparam_spike_celseq2.png 84KB evalderes_conditional_celseq2.png 80KB evalderes_conditional_celseq2.png 80KB evalplot1-1.png 78KB evaldist.png 78KB evalsimres_celseq2.png 69KB evalsimres_celseq2.png 69KB evaldist_smartseq2.png 69KB evaldist_smartseq2.png 69KB plottwogrp-1.png 39KB evalderes_marginal_celseq2.png 39KB evalderes_marginal_celseq2.png 39KB evaltime_celseq2.png 20KB共 185 条
- 1
- 2
评论0