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适用于基因组和剪接核苷酸序列的通用成对比对器-C/C++开发
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2021-05-26
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入门git clone https://github.com/lh3/minimap2 cd minimap2 &&对参考基因组进行长时间读取./minimap2 -ax map10k test / MT-human.fa test / MT-orang.fa> test.sam #首先创建一个索引,然后开始使用git clone https://github.com/lh3/minimap2 cd minimap2 &&对参考基因组进行长序列./minimap2 -a test / MT-human.fa test / MT-orang .fa> test.sam#首先创建一个索引,然后映射./minimap2 -x map-ont -d MT-human-ont.mmi test / MT-human.fa ./minimap2 -a MT-human-ont.mmi test / MT-orang.fa> test.sam#使用预设(无测试数据)。/minimap2 -ax map-pb ref.fa pacbio.fq.gz> aln.sam#PacBio基因组读取./mini
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lib
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西西里上尉
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