MATLAB
大规模钙成像数据分析的计算工
具箱。该代码实现了 CNMF 算
法，用于从大规模钙成像电影中
同时进行源提取和尖峰推断。包
括更多功能（见下文）。该代码
适用于体细胞成像数据的分析。
未来将添加树突状/轴突成像数
据分析的改进实施。
包含的功能和方法
� 来源提取
o 基于约束非负矩
阵分解 (CNMF)
o 处理严重重叠和
受神经细胞污染
的电影
o 使用预训练的卷
积神经网络分类
器选择推断源
o 跨不同会话/天的
组件注册
� 去噪、反卷积和尖峰提取
o 从荧光痕迹推断神经活动的约束 foopsi 方法
o 使用 OASIS algorihtm
o 用于贝叶斯尖峰推理的 MCMC 算法
� 处理非常大的数据集
o 补丁中的内存映射和并行处理
� 运动校正
o 使用 NoRMCorre 算法的快速可并行非刚性运动校正。找到单独的独
立包。将来它将包含在这个包中。
