伪氨基酸

基于分段伪氨基酸组成成分特征提取方法预测蛋白质亚细胞定位 本文详细描述了基于分段伪氨基酸组成成分特征提取方法预测蛋白质亚细胞定位

评级：0 浏览量：169 收藏量：0 资源大小：252KB 上传时间：2015-10-21

通过结合伪氨基酸组成和基于谱的蛋白质表示法鉴定DNA结合蛋白 通过结合伪氨基酸组成和基于谱的蛋白质表示法鉴定DNA结合蛋白

评级：0 浏览量：73 收藏量：0 资源大小：876KB 上传时间：2021-03-20

用伪氨基酸组成预测蛋白质结构分类：利用细胞自动机图像的几何矩的方法 用伪氨基酸组成预测蛋白质结构分类：利用细胞自动机图像的几何矩的方法

评级：0 浏览量：79 收藏量：0 资源大小：578KB 上传时间：2021-02-23

通过将进化和酸解离信息纳入Chou的一般伪氨基酸成分中来鉴定嗜热蛋白 通过将进化和酸解离信息纳入Chou的一般伪氨基酸成分中来鉴定嗜热蛋白

评级：0 浏览量：49 收藏量：0 资源大小：323KB 上传时间：2021-05-11

TargetFreeze：使用序列进化信息和伪氨基酸组成，通过权重的组合来识别抗冻蛋白 TargetFreeze：使用序列进化信息和伪氨基酸组成，通过权重的组合来识别抗冻蛋白

评级：0 浏览量：64 收藏量：0 资源大小：529KB 上传时间：2021-04-16

TargetFreeze：使用序列进化信息和伪氨基酸组成通过权重组合来识别抗冻蛋白 TargetFreeze：使用序列进化信息和伪氨基酸组成通过权重组合来识别抗冻蛋白

评级：0 浏览量：57 收藏量：0 资源大小：530KB 上传时间：2021-02-26

基于化学位移和伪氨基酸组分信息预测抗凋亡蛋白质与促凋亡蛋白质 建立一个新的凋亡蛋白质数据集,并基于化学位移信息和伪氨基酸组分信息采用支持向量机(SVM)方法对新的数据集进行了预测.融合后的特征信息用Jackknife检验预测成功率达到77.01%,从预测结果可以看出提取有效的特征信息...

评级：0 浏览量：60 收藏量：0 资源大小：292KB 上传时间：2021-03-12

采用伪氨基酸组成预测水解酶亚家族 (2010年) 利用伪氨基酸组成提取蛋白序列特征值,考察参数λ和 w对识别效果的影响,以 k-近邻作为基础分类器,用于预测水解酶的亚家族类型。结果表明,伪氨基酸组成特征提取法与单纯的20个氨基酸组成特征方法相比,其识别精度有较大...

评级：0 浏览量：45 收藏量：0 资源大小：729KB 上传时间：2021-06-12

基于改进伪氨基酸组成的蛋白质相互作用预测 (2009年) 提出了一种新的基于改进的伪氨基酸组成特征模型与随机森林的蛋白质相互作用预测方法。首先利用基于Geary自相关函数的伪氨基酸组成特征模型，对与蛋白质相互作用相关的氨基酸属性进行评价，然后根据评价结果选择相关...

评级：0 浏览量：62 收藏量：0 资源大小：386KB 上传时间：2021-05-06

基于伪氨基酸组成预测水解酶亚家族的研究 基于伪氨基酸组成预测水解酶亚家族的研究，李红春，张光亚，预测水解酶亚家族对于开发快速、准确的水解酶分类自动化系统具有重要意义。本文利用伪氨基酸组成提取蛋白序列特征值，考察了参数

评级：0 浏览量：104 收藏量：0 资源大小：633KB 上传时间：2020-02-05

iDNA-Prot | dis：通过将氨基酸距离对和降低的字母特征整合到一般的伪氨基酸组成中来鉴定DNA结合蛋白 iDNA-Prot | dis：通过将氨基酸距离对和降低的字母特征整合到一般的伪氨基酸组成中来鉴定DNA结合蛋白

评级：0 浏览量：49 收藏量：0 资源大小：896KB 上传时间：2021-03-28

使用伪氨基酸成分鉴定结核分枝杆菌中的分泌蛋白 使用伪氨基酸成分鉴定结核分枝杆菌中的分泌蛋白

评级：0 浏览量：33 收藏量：0 资源大小：1.56MB 上传时间：2021-03-04

使用伪氨基酸组成和 BP神经网络预测类弹性蛋白多肽的相变温度 (2011年) 根据获得的16条ELP序列及相变温度的数据,利用伪氨基酸组成方法提取其序列特征值。将伪氨基 酸组成中的相关系数部分作为类弹性蛋白的特征向量,从类弹性蛋白序列出发,利用最小中位方差回归,找出 与其序列相关系数的...

评级：0 浏览量：53 收藏量：0 资源大小：657KB 上传时间：2021-06-12

基于伪氨基酸组成和支持向量机预测人类蛋白质亚细胞定位的研究 (2012年) 蛋白质亚细胞定位是当前生物信息学和蛋白质科学的重要研究领域，本研究从蛋白质一级序列出发，取伪氨基酸组成向量作为输入数据，运用支持向量机作为预测工具，对人类12类蛋白质亚细胞的定位进行预测，得到独立检验的...

评级：0 浏览量：54 收藏量：0 资源大小：296KB 上传时间：2021-05-31

基于伪氨基酸组成和PSI-Blast谱的蛋白质亚细胞定位预测 基于伪氨基酸组成和PSI-Blast谱的蛋白质亚细胞定位预测

评级：0 浏览量：114 收藏量：0 资源大小：242KB 上传时间：2021-03-16

通过top-n-gram方法将进化信息整合到伪氨基酸组成中，从而鉴定DNA结合蛋白。 通过top-n-gram方法将进化信息整合到伪氨基酸组成中，从而鉴定DNA结合蛋白。

评级：0 浏览量：67 收藏量：0 资源大小：439KB 上传时间：2021-03-28

DSPMP：通过混合Chou伪氨基酸模式的不同描述符来区分疟疾寄生虫的分泌蛋白。 DSPMP：通过混合Chou伪氨基酸模式的不同描述符来区分疟疾寄生虫的分泌蛋白。

评级：0 浏览量：27 收藏量：0 资源大小：1.1MB 上传时间：2021-04-02

PseAAC-Builder 2.0: 一种从蛋白质序列数据快速生成伪氨基酸组分表示的软件 PseAAC-Builder 2.0: 一种从蛋白质序列数据快速生成伪氨基酸组分表示的软件，杜朴风，，本文描述了一种用于快速的将大规模蛋白质序列数据转换成伪氨基酸组分的软件。这一软件称为PseAAC-Builder 2.0. 这一软件比现有...

评级：0 浏览量：517 收藏量：0 资源大小：274KB 上传时间：2020-01-02

MultiP-SChlo：利用周氏假氨基酸组成和新型多标签分类器进行多标签蛋白质亚叶绿体定位预测 MultiP-SChlo：利用周氏假氨基酸组成和新型多标签分类器进行多标签蛋白质亚叶绿体定位预测

评级：0 浏览量：85 收藏量：0 资源大小：168KB 上传时间：2021-03-06

氨基酸约化分类对亚线粒体蛋白定位的预测* (2011年) 提出了最佳组合参数，该参数是ω=0．10，λ=22时亲疏水残基指数值及平行相关形式的伪氨基酸组分结合全序列单肽组分，利用支持向量机算法进行预测，达到了较好的预测结果．利用本文提出的最佳组合参数对未知蛋白

评级：0 浏览量：40 收藏量：0 资源大小：393KB 上传时间：2021-05-19

音视频-编解码-蛋白质亚细胞定位的序列编码及预测方法研究.pdf 在蛋白质序列特征信息的伪氨基酸组成方法方面，本文提出了一种基于疏水氨基酸及其他类氨基酸在蛋白质序列中的位置分布信息的伪氨基酸组成方法，然后基于蛋白质序列特征信息的多样性和差异性，构建了由多个支持向量机...

评级：0 浏览量：41 收藏量：0 资源大小：3.12MB 上传时间：2022-04-16

安氏伪镖水蚤精氨酸激酶cDNA的克隆及镍胁迫下的表达特性 (2013年) 为探讨镍胁迫对桡足类影响的分子...开放阅读框1 068 bp，编码355个氨基酸残基，预测蛋白质分子质量为39．43 ku．Blast分析结果显示，安氏伪镖水蚤AK cDNA与罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)、多齿新米虾(Neocaridi

评级：0 浏览量：45 收藏量：0 资源大小：487KB 上传时间：2021-05-31

matlab2014a代码-ECMP-RF:融合多特征信息、弹性网络和随机森林算法预测细胞外基质蛋白 是伪氨基酸组成的实现。 LD 是本地描述符的实现。 **SMOTE：SMOTE_R_train_test.R 是 SMOTE 的实现 ** 特征选择：LOOCV_EN.py 代表弹性。 LOOCV_KPCA.py 代表 KPCA。 LOOCV_LASSO.py 代表 LASSO。 LOOCV_PCA.py 代表...

评级：0 浏览量：324 收藏量：1 资源大小：36.71MB 上传时间：2021-06-08

基于深度学习的蛋白质二级结构预测.pdf 本文提出了一种基于深度学习的蛋白质二级结构预测方法，通过采用近似熵、疏水模式和图像特征组成的伪氨基酸组分方法来提取蛋白质序列的特征，并使用五层深度玻尔兹曼机（DBM）和分类层来预测蛋白质的二级结构分类...

评级：0 浏览量：53 收藏量：0 资源大小：320KB 上传时间：2021-08-31

EP-GBDT:EP-GBDT是仅通过使用序列信息来预测必需蛋白质的一种计算方法 在“加工的特征”文件夹中，我们提供了通过伪氨基酸组成（PseAAC）工具获得的加工的蛋白质序列特征。 在通过8种中心方法得出的预测结果中，我们提供了原始PPI网络和8种中心方法的结果。 data_h.pkl和data_y.pkl用于...

评级：0 浏览量：98 收藏量：0 资源大小：18.29MB 上传时间：2021-03-25

matlab如何敲代码-PlmDCA:Julia（Julia）中蛋白质的伪似然最大化 中的伪似然最大化。 有关该算法的完整说明，请参见。 如果使用此算法，则应引用： M. Ekeberg，C.Lovkvist，Y.Lan，M.Weigt，E.Aurell，改善蛋白质中的接触预测：使用拟似然性推断Potts模型，Phys。 修订版E 87，...

评级：0 浏览量：151 收藏量：0 资源大小：334KB 上传时间：2021-05-23

论文研究 - mLysPTMpred：结合使用SVM和解决数据不平衡问题的多个赖氨酸PTM站点预测 在这里，我们开发了一种称为mLysPTMpred的计算工具，可通过以下步骤来预测多标签赖氨酸PTM位点：1）将序列耦合的信息整合到一般的伪氨基酸组成中，2）通过“不同错误成本”方法平衡偏斜训练数据集的影响，和3）使用...

评级：0 浏览量：157 收藏量：0 资源大小：636KB 上传时间：2020-05-25

PseAAC-Builder-开源 PseAAC-General：针对大型蛋白质数据集，快速构建Chou的伪氨基酸组成的多种形式的通用模式。 国际分子科学杂志15（2014）pp.3495-3506 [2]杜朴凤，王鑫，徐超，杨高。 PseAAC-Builder：跨平台的独立程序，用于生成...

评级：0 浏览量：251 收藏量：0 资源大小：2.23MB 上传时间：2021-04-28

改进的离散增量算法预测27类折叠子的结构类型* (2009年) 本文从蛋白质的一级序列出发，提出了一种改进的预测算法：以二肽组分、预测的二级结构信息、伪氨基酸组分和位置权重矩阵打分值等特征分别作为参数，输入离散增量算法的单分类器中，通过加权融合单分类器的计算结果，...

评级：0 浏览量：36 收藏量：0 资源大小：321KB 上传时间：2021-06-13

论文研究-序列信息融合与两阶段特征选择的膜蛋白预测.pdf 抽取膜蛋白序列信息中的伪氨基酸组成、二肽组成和位置特异性分数矩阵等特征融合后作为特征参数，并在融合过程中提出一种改进的ReliefF算法（FReliefF）得到更有效的特征分数。基于Stacking集成学习框架，两次使用...

评级：0 浏览量：87 收藏量：0 资源大小：696KB 上传时间：2019-09-12

论文研究-基于距离矩阵灰度图的蛋白质二级结构类型预测.pdf 基于伪氨基酸成分表示蛋白质的方法，能提高蛋白质结构和功能预测的成功率，利用蛋白质距离矩阵灰度图，基于几何矩提出了一种伪氨基酸构造方法，结合氨基酸的成分对蛋白质二级结构类型进行预测，通过国际公认的...

评级：0 浏览量：143 收藏量：1 资源大小：645KB 上传时间：2019-07-22

vcf-annotator:向给定 VCF 文件中的变体添加生物学注释 下面描述了完整的注释列表，其中包括氨基酸变化、基因信息、同义与非同义、基因座标签信息等等。 添加注释 对于每个突变，如果适用，将在 VCF 的 INFO 列中添加以下注释。 注解 描述 参考密码子 参考密码子 替代...

评级：0 浏览量：176 收藏量：0 资源大小：5.84MB 上传时间：2021-05-29

rnalign2d：使用MUSCLE和二级结构数据执行RNA的多序列比对的Python工具 该工具首先去除常见的RNA修饰，然后将RNA序列和二级结构转换为假氨基酸序列（请不要误解翻译过程-这只是技术解决方案），然后使用MUSCLE来比对假氨基酸序列。 最后恢复过程，并恢复与原始序列和二级结构的比对。 点...

评级：0 浏览量：189 收藏量：1 资源大小：114KB 上传时间：2021-02-18

论文研究-基于随机信号全序列特征的蛋白质亚细胞定位 .pdf 基于随机信号全序列特征的蛋白质亚细胞定位，肖绚，邵世煌，当今生物信息学领域中，蛋白质亚细胞定位是一个重要和富有挑战的工作。在伪氨基酸成分和随机信号处理方法的基础上，本文提出了一

评级：0 浏览量：105 收藏量：0 资源大小：288KB 上传时间：2019-08-16

StatAlign:可扩展的统计多重比对工具。-开源 StatAlign是用于蛋白质，DNA和RNA序列的贝叶斯分析的可扩展软件包。 在马尔可夫链蒙特卡洛框架中可以共同估计多个比对，系统树和... 包装盒中包含多种核苷酸和氨基酸数据模型，并且插件管理系统可确保轻松添加新模型。

评级：0 浏览量：78 收藏量：0 资源大小：5.33MB 上传时间：2021-04-29

matlab分析成绩代码-plmDCA:plmDCA （2）M.Ekeberg，T.Hartonen，E.Aurell，快速伪似然最大化，用于直接分析许多同源氨基酸序列的蛋白质结构，J.Comput。 物理276，341-356（2014） 如果您使用plmDCA（已修改或原样）进行自己的研究，请引用上面的论文...

评级：0 浏览量：171 收藏量：0 资源大小：637KB 上传时间：2021-05-28