matlab分析成绩代码-plmDCA:plmDCA

matlab分析成绩代码plmDCA 该存储库包含用于plmDCA的MATLAB代码（以及随附的C编写例程）。 plmDCA将多序列比对作为输入，并返回各列之间成对（直接）相互作用的得分。 该方法的详细描述如下： （1）M.Ekeberg，C.Lövkvist，Y.Lan，M.Weigt，E.Aurell，改善蛋白质中的接触预测：使用拟似然性推断Potts模型，Phys。 修订版E 87，012707（2013） （2）M.Ekeberg，T.Hartonen，E.Aurell，快速伪似然最大化，用于直接分析许多同源氨基酸序列的蛋白质结构，J.Comput。 物理276，341-356（2014） 如果您使用plmDCA（已修改或原样）进行自己的研究，请引用上面的论文。 有关版权条件和有关如何使用该代码的说明，请参见文件。 发送评论和建议至magnus.ekerberg（at）gmail（dot）com。 plmDCA有两种版本：（1）中的原始“对称”版本和（2）中的新“非对称”版本。 后者速度更快，同时产生的输出与原始输出几乎相同。 因此，目前，我们建议使用不对称的变体。 关键词：p