DNA序列比对

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DNA序列比对

: lastz:DNA序列比对程序，成对比对器 LASTZ-成对DNA序列比对器该存储库包含LASTZ的最新官方工作分支。正式发行带有标签，可以在找到。鼓励用户使用带标签的发行版，因为此工作分支可能不稳定。在撰写本文时，最新的正式版本是1.04.03版。可以在 ...
评级：0 浏览量：1669 收藏量：0 资源大小：5.21MB 上传时间：2021-05-06

: Pontos:Pontos根据DNA序列比对计算距离矩阵。-开源 Pontos是一种易于使用的图形Java程序，用于根据PHYLIP格式的DNA序列比对计算未校正的距离（或相似性）矩阵。它还会与常规对齐方式产生“差异”对齐（反之亦然）。它可以以不同的方式处理差距和歧义。缺口可以是：...
评级：0 浏览量：161 收藏量：0 资源大小：37KB 上传时间：2021-04-29

: DNASequenceAlignment:DNA 序列比对、学习错配、匹配和缺口。它只适用于相同长度的两个 dna 序列 DNA序列比对 DNA 序列比对、学习错配、匹配和缺口。它仅适用于两个相同长度的 dna 序列。添加了 Java 代码。添加了两个屏幕截图。更多信息： :
评级：0 浏览量：119 收藏量：0 资源大小：38KB 上传时间：2021-06-18

: 云计算-基于GPU高性能计算的下一代高通量DNA序列比对.pdf "云计算-基于GPU高性能计算的下一代高通量DNA序列比对" 本文主要介绍了基于GPU高性能计算的下一代高通量DNA序列比对技术。随着生物学研究中DNA测序技术的革命性突破，高通量测序技术的应用越来越广泛。下一代测序...
评级：0 浏览量：61 收藏量：0 资源大小：9.78MB 上传时间：2022-06-30

: sequencher DNA序列比对分析软件一款DNA序列比对的软件，可用于DNA序列的分析、比对，酶切位点的查找等。
评级：4 浏览量：1097 收藏量：5 资源大小：14.86MB 上传时间：2014-06-28

: js DNA动态序列比对代码 JavaScript动态序列比对代码，随便写着玩的，在网上见到用VC、VB写的比较多，这个算法以前在高中课本上见到过，我只是用Js写一下试试，或许还不是太准确。
评级：0 浏览量：189 收藏量：1 资源大小：29KB 上传时间：2020-10-29

: edyeet:使用edlib和mashmap2进行碱基精确的DNA序列比对 它使用高性能的比对模块完善了MashMap，该模块能够计算非常大的序列的基本水平比对。过程每个查询序列分为-s[N], --segment-length=[N]定义的非重叠部分。然后使用MashMap的滑动minhash映射算法和后续的过滤步骤来...
评级：0 浏览量：112 收藏量：0 资源大小：1.19MB 上传时间：2021-05-11

: wfmash:使用WFA和mashmap2进行碱基精确的DNA序列比对 一种基于mash距离和波前比对算法的DNA序列读取作图仪。 wfmash是一个叉，使用工具基层对准，经由瓷砖波前全局比对算法。它使用高性能的比对模块完善了MashMap，该模块能够计算非常大的序列的基本水平比对。...
评级：0 浏览量：189 收藏量：0 资源大小：2.51MB 上传时间：2021-04-06

: 序列比对器多平台体系结构（MASA）是一种灵活的软件框架，可简化在多个硬件软件平台中创建DNA序列比对应用... 用于序列比对器的多平台体系结构（MASA）是一种灵活的软件框架，可简化在多个硬件/软件平台中创建DNA序列比对应用程序的过程。该框架支持将巨大的DNA序列与超过2亿个碱基对（MBP）进行比对。 MASA-Core库基于...
评级：0 浏览量：146 收藏量：0 资源大小：3.02MB 上传时间：2021-05-13

: Swift Sequence Alignment Program:使用Smith-Waterman的基于GPU的DNA序列比对程序-开源 Swift是一个DNA序列比对程序，使用Smith-Waterman算法产生缺口比对。它以查询文件（FASTA格式）和参考文件（FASTA格式）为输入。它输出参考名称，读取名称，空位比对，比对得分，比对开始和结束位置以及比对...
评级：0 浏览量：79 收藏量：0 资源大小：467KB 上传时间：2021-04-30

: cljam：Clojure的DNA序列比对图（SAM）库 cljam：Clojure的DNA序列比对图（SAM）库
评级：0 浏览量：57 收藏量：0 资源大小：18.64MB 上传时间：2021-01-31

: DNA序列比对分析中的统计特征方法 (2005年) 提出了一种新的基于统计的序列特征定义,并以此对进化树进行...同时对这一方法进行了分类测试和进化树构建测试,发现所得测试结果与同样是用进化树进行构建的基于两序列比对的传统算法比较,其性能和适用性都有明显改善.
评级：0 浏览量：40 收藏量：0 资源大小：785KB 上传时间：2021-05-30

: 生物DNA序列比对算法研究生物DNA序列比对算法研究！！！生物DNA序列比对算法研究！！！生物DNA序列比对算法研究！！！
评级：0 浏览量：291 收藏量：1 资源大小：237KB 上传时间：2011-07-08

: alignmentbd:已实现的DNA序列比对算法的集合，包括最佳全局比对，带状全局比对和用于多序列比对的近似算法对齐方式已实现的DNA序列比对算法的集合，包括最佳全局比对，带状全局比对和用于多个序列比对的近似算法。
评级：0 浏览量：94 收藏量：0 资源大小：151KB 上传时间：2021-04-30

: DNA序列局部比对算法 Smith-Waterman 算法的实现配对错位缺失后得到的分值
评级：0 浏览量：504 收藏量：0 资源大小：14.62MB 上传时间：2018-03-09

: cudasmithwaterman:用于 DNA 序列比对的 Smith Waterman 算法的 GPU 加速 (CUDA) 实现库达史密斯沃特曼用于 DNA 序列比对的 Smith Waterman 算法的 GPU 加速 (CUDA) 实现。
评级：5 浏览量：111 收藏量：1 资源大小：152KB 上传时间：2021-06-20

: DNA序列翻译为氨基酸 perl 代码写的 DNA序列比对，用的是smith比对的算法，只要提交输入比较比对即可
评级：0 浏览量：1498 收藏量：0 资源大小：3KB 上传时间：2017-10-14

: 详解基于python的全局与局部序列比对的实现(DNA) 输出序列比对结果 d.使用matplotlib对得分矩阵路径的绘制一、实现步骤 1.用户输入步骤 a.输入自定义的gap值 b.输入需要比对的碱基序列1（A,T,C,G）换行表示输入完成 b.输入需要比对的碱基序列2（A,T,C,G）换行表示...
评级：0 浏览量：1661 收藏量：1 资源大小：475KB 上传时间：2020-12-16

: SWAPHI-LS: Alignment on Xeon Phi Cluster:Smith-Waterman在Xeon Phi簇上的长DNA序列比对-开源第一个并行的Smith-Waterman算法利用Intel Xeon Phi群集来加速长DNA序列的比对。该算法是用C ++（具有一组SIMD内部扩展），OpenMP和MPI编写的。性能评估表明，我们的算法实现了非常稳定的性能，在单个至强融核上...
评级：0 浏览量：60 收藏量：0 资源大小：35KB 上传时间：2021-04-26

: sequentify:用于对齐DNA序列的Web应用程序 Sequentify是一个比对DNA序列的开源Web应用程序。该应用程序的目的主要是用作教育工具，因为它允许通过轻松更改功能变量来探索对齐功能。但是，它对于只需要序列之间快速可自定义比对的研究人员也很有用。对于更...
评级：0 浏览量：99 收藏量：0 资源大小：27KB 上传时间：2021-05-08

: JFinisher:JFinisher是用于比对，编辑和操纵DNA序列的软件-开源 JFinisher是用于比对，编辑和操纵生物序列的软件。它旨在帮助完成基因组组装。从参考序列开始，程序使用Smith-Waterman局部比对算法和辅助方法对重叠群进行比对，从而可以管理所产生的比对。它具有图形界面，可...
评级：0 浏览量：62 收藏量：0 资源大小：1.3MB 上传时间：2021-04-29

: DNA序列分析软件 DNAssit 3.10 可用于64位windows DNA序列分析软件 DNAssit 3.10 可用于64位windows，DNAssist可不仅仅是对测序结果的
评级：0 浏览量：827 收藏量：0 资源大小：9.17MB 上传时间：2019-05-26

: 进化算法在DNA序列比对中的应用关于生物信息学的资料上面是进化算法在基因序列中的应用
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: CUDAlign:CUDAlign是在具有CUDA功能的GPU中比对巨大DNA序列的工具-开源 CUDAlign是一种工具，可以使用Smith-Waterman算法与Myers-Miller结合使用，在CUDA GPU中比对大小不受限制的成对DNA序列。使用GTX 560 Ti，可以在45秒内产生100万个碱基序列的最佳比对。正在为此软件开发许多优化。...
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: DNA序列动态规划法比对的C代码 DNA序列动态规划法比对的C代码,生物信息学的内容，动态规划法
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: bioedit DNA序列分析 DNA测序后用来分析序列用 bioedit DNA序列分析
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: 基于改进蚁群算法的DNA双序列比对 (2010年) 序列比对是生物信息学中基本的信息处理方法之一.DNA序列比对分为多序列比对和双序列比对两种.本文首先分析了经典蚁群算法在双序列比对中的应用，然后针对经典蚁群算法收敛速度慢和陷入局部最优值等缺点进行改进，...
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: 一维成对CNN用于两个DNA序列的整体比对一维成对CNN用于两个DNA序列的整体比对
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: alignTools.C:序列比对（C）的实现 alignTools是用于逐对DNA序列比对的C实现工具的集合。它包括以下对齐功能：整体一致性局部语言适合对齐（跳跃状态）重叠对齐编辑距离不久的将来将添加更多功能。版本 0.7.23-r15 开始使用安装 $ git ...
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: ai-msa:用于 DNA 匹配的多序列比对 多序列比对尽可能接近地映射不同的字符串。一项主要应用是 DNA 匹配描述词汇表 V 中有 K 个字符串 Xi。每个字符串 Xi 的长度为 Ni。目标是将字符串相互映射。转换是一个函数 F，它接受一个字符串并返回另一个字符...
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: MashMap:适用于长DNA序列的快速近似比对仪 MashMap实现了一种快速且近似的算法，用于计算长DNA序列之间的局部比对边界。对于将基因组装配或长读（PacBio / ONT）映射到参考基因组可能很有用。给定最小对齐长度和所需局部对齐的同一性阈值，Mashmap使用k -...
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: 序列比对的一些算法思想.pptx 序列比对是生物信息学中的核心任务之一，其主要目的是在DNA、RNA或蛋白质序列中找到相似性，以便理解它们的进化关系、功能和结构。本篇内容将深入探讨序列比对的一些算法思想。首先，序列比对的意义在于确定序列间...
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: Sequence-Alignment-Algorithm:DNARNAProtein 序列比对 Java 序列比对算法DNA/RNA/蛋白质序列比对什么是在生物信息学中，序列比对是一种排列 DNA、RNA 或蛋白质序列以识别可能是序列之间功能、结构或进化关系结果的相似区域的方法。这个怎么运作使用 2 个序列（字符串）作为...
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: 1131：基因相关性.cpp 现比对两条长度相同的DNA序列。定义两条DNA序列相同位置的碱基为一个碱基对，如果一个碱基对中的两个碱基相同的话，则称为相同碱基对。接着计算相同碱基对占总碱基对数量的比例，如果该比例大于等于给定阈值时则判定...
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