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Sequence-Alignment-Algorithm:DNARNAProtein 序列比对 Java
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2021-06-12
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序列比对算法 DNA/RNA/蛋白质序列比对 什么是 在生物信息学中,序列比对是一种排列 DNA、RNA 或蛋白质序列以识别可能是序列之间功能、结构或进化关系结果的相似区域的方法。 这个怎么运作 使用 2 个序列(字符串)作为输入创建一个 SequenceAlignmentAlgorithm 对象。 该算法建立了一个分数矩阵,代表每个可能的路径(组合)。 最短的路径是最好的,这意味着序列是对齐的。 输出示例 序列对齐算法 输入: 卡塔卡塔 TCCACTTA 输出: 卡塔卡塔 -T-CC-AC-TTA 留下来做 需要一些小的调整,有一些例外,输出对齐不是 100% 完美。
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Sequence-Alignment-Algorithm-master.zip (7个子文件)
Sequence-Alignment-Algorithm-master
src
api
algorithm
SequenceAlignmentAlgorithm.java 4KB
main
MainSAATester.java 1KB
LICENSE 1KB
README.md 833B
input.txt 23B
bin
api
algorithm
SequenceAlignmentAlgorithm.class 3KB
main
MainSAA.class 2KB
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Jeckaijew
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