下一代测序

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下一代测序

: 下一代测序纠错方法综述的各种下一代测序的纠错技术. 首先,从各种不同工具所基于的底层算法进行分析;接着,从测序不同平台来看读.段错误形成的特点;然后,从各种不同的测序应用角度来观察读段序列错误特征;最后,总结并阐述读段序列纠错.工具...
评级：0 浏览量：61 收藏量：0 资源大小：882KB 上传时间：2021-05-18

: 使用决策树从下一代测序数据中快速调用变体的研究使用决策树从下一代测序数据中快速调用变体的研究
评级：0 浏览量：46 收藏量：0 资源大小：997KB 上传时间：2021-03-27

: 纳米技术，下一代测序和微阵列在生物医学研究中的应用纳米技术，下一代测序和微阵列在生物医学研究中的应用
评级：0 浏览量：49 收藏量：0 资源大小：302KB 上传时间：2021-03-29

: ngseasy：Dockerized下一代测序管道（QC，对齐，调用，注释） ngseasy：Dockerized下一代测序管道（QC，对齐，调用，注释）
评级：0 浏览量：66 收藏量：0 资源大小：1.95MB 上传时间：2021-02-05

: 通过下一代测序数据再分析对多置换扩增产生的嵌合体进行系统特性探索通过下一代测序数据再分析对多置换扩增产生的嵌合体进行系统特性探索
评级：0 浏览量：88 收藏量：0 资源大小：1.01MB 上传时间：2021-03-28

: 优秀资料（2021-2022年收藏）下一代测序NGS法传染病病原微生物酸检测试剂.doc 教育精品资料
评级：0 浏览量：53 收藏量：0 资源大小：109KB 上传时间：2021-09-29

: SOAPdenovo2:下一代测序从头读 MEGAHIT可处理单细胞测序数据和超基因组数据。与SOAPdenovo相比，它生成更长的重叠群，并消耗更少的内存。要搭建由MEGAHIT生成的重叠群，请使用SOAPdenovo-fusion。它是一个准备模块，它将重叠群作为输入并生成...
评级：0 浏览量：199 收藏量：0 资源大小：1.57MB 上传时间：2021-05-14

: 论文研究-面向下一代测序技术的结构变异检测算法综述.pdf 全面总结了现有面向下一代测序技术的结构变异检测算法：配对末端匹配法、读深度法、分裂读数据法和序列拼接法，分析各算法核心思想及其特点，给出其适用范围和优缺点，并探讨了检测算法存在的问题和发展趋势。
评级：0 浏览量：119 收藏量：1 资源大小：813KB 上传时间：2019-07-22

: HomSI:来自下一代测序数据的纯合子拉伸标识符-开源近来，下一代测序的问世使得能够使用来自单个测序实验的数据同时鉴定纯合区域并检测与诊断相关的突变。在这方面，我们开发了一种新颖的工具，可使用深度序列数据识别纯合子区域。使用* .vcf文件作为输入文件，...
评级：0 浏览量：82 收藏量：0 资源大小：1.65MB 上传时间：2021-04-29

: spades-runner:使用SPAdes批量组装下一代测序读物黑桃跑者 spades-runner是一个命令行应用程序，用于使用SPAdes批量组装下一代测序读取。它旨在通过最少的配置文件到无配置的文件简化批处理组装过程。目录快速开始如果您的文件夹结构类似于或或者使用任一程序来...
评级：0 浏览量：445 收藏量：0 资源大小：17KB 上传时间：2021-03-27

: ngs-ml:下一代测序和机器学习 下一代测序和机器学习使用和使用Conda运行笔记本从下载miniconda 打开Anaconda Prompt并转到ngs-ml文件夹（ cd <PATH> ）键入conda env create -f environment.yml -p ./env （这可能需要一段时间）使用conda ...
评级：0 浏览量：120 收藏量：0 资源大小：8KB 上传时间：2021-03-19

: ezRun:用于分析下一代测序数据的 R 元包易润用于分析下一代测序数据的 R 元包。 ezRun包的版本绑定了 Bioconductor 开发分支的发布。Python 包的依赖关系 pip3 install velocyto magic - imputepip3 install multiqcR/Bioconductor 包的依赖关系 packages ...
评级：0 浏览量：74 收藏量：0 资源大小：124.69MB 上传时间：2021-07-23

: 基于下一代测序的重复序列组装器基于下一代测序的重复序列组装器
评级：0 浏览量：53 收藏量：0 资源大小：1.07MB 上传时间：2021-03-07

: 最新高通量测序技术(下一代测序技术)原理及应用[汇编].pdf 最新高通量测序技术(下一代测序技术)原理及应用[汇编].pdf
评级：5 浏览量：401 收藏量：0 资源大小：2.78MB 上传时间：2021-10-14

: haptreex：单倍型移相器，用于下一代测序数据 HapTree-X是一种计算工具，可以分阶段各种下一代测序数据。目前，它支持全基因组，全外显子组，10X基因组学和RNA序列数据。它对RNA-seq数据特别有用，因为它可以利用等位基因失衡来获得更好的相位基因区域。安装...
评级：0 浏览量：52 收藏量：0 资源大小：42KB 上传时间：2021-02-15

: SeedsGraph：用于下一代测序数据的高效汇编程序。 SeedsGraph：用于下一代测序数据的高效汇编程序。
评级：0 浏览量：66 收藏量：0 资源大小：1.07MB 上传时间：2021-03-03

: parkour:下一代测序（NGS）的开源实验室信息管理系统（LIMS）跑酷LIMS（实验室信息管理系统）是一个软件包，用于样品处理和下一代测序（NGS）数据和样品的质量管理。除了广泛的功能之外，大多数现有的LIMS都缺少电子实验室笔记本方面的功能，无法支持，组织和最终标准化实验室...
评级：0 浏览量：361 收藏量：1 资源大小：71.32MB 上传时间：2021-05-14

: Pop-seq:人口模拟器解决下一代测序问题-开源 Pop-seq是一个基于perl的仿真工具... 结合Seq-sim工具，您可以生成合并的或条形码的下一代测序偏向结果。该工具用于解决实验设计中的重复出现的问题（例如，建议在反向杂交或不杂交的情况下选择多少株植物或测序深度）
评级：0 浏览量：76 收藏量：0 资源大小：50KB 上传时间：2021-04-29

: DWGSIM:用于下一代测序的全基因组模拟器欢迎使用DWGSIM。有关详细信息，请参见文件LICENSE。请参阅文件INSTALL以获取安装说明。由于该软件包不再处于主动开发中，因此其支持有限。克隆此存储库时，请使用以下命令： git clone --recursive ...
评级：0 浏览量：319 收藏量：0 资源大小：2.12MB 上传时间：2021-05-23

: Genobuntu:用于下一代测序的Genobuntu软件包-开源 Genobuntu是一个软件包，包含70多个面向NGS的软件和软件包。在当前版本中，Genobuntu支持预组装工具，基因组组装器以及后组装工具。还提供了用于不同装配流水线的常用生物软件和示例脚本文件，可以在其中更新示例...
评级：0 浏览量：49 收藏量：0 资源大小：137.82MB 上传时间：2021-04-29

: 基于下一代测序数据的重复查找器算法，在几乎所有的真核生物基因组中，不同长度的重复序列都很常见，据推测其中大多数具有重要的调控功能，并可能导致基因组不稳定。... 结果表明，在高覆盖率条件下，重复序列的组装精度和估计的拷贝数分别高达99％和100％。
评级：0 浏览量：102 收藏量：0 资源大小：228KB 上传时间：2021-03-17

: asgc:下一代测序的数据压缩（课堂项目）协会下一代测序的数据压缩（课堂项目）
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: ngs-slider:我的自制管道，用于获取下一代测序数据并找到合适的变体！我的自制管道，用于获取下一代测序数据并找到合适的变体！旨在遵循 GATK 网站的最佳实践页面 - 当给定生物信息学中的 fastq 文件时，目标是运行合理数量的工具并最终生成 vcf 文件。该程序允许您从这些步骤中的...
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: NGSEP:NGSEP（下一代测序体验平台）-开源 NGSEP是用于分析DNA高通量测序数据的集成框架。 NGSEP的主要用途是大型基因组变异数据集的构建和下游分析。 NGSEP对单核苷酸变体（SNV），小和大插入缺失，短串联重复序列（STR），倒置和拷贝数变体（CNV）进行准确...
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: DETEQT:用于靶向传染病下一代测序 (NGS) 数据的诊断软件-matlab开发诊断目标测序裁决 (DETEQT) 软件旨在处理靶向传染病下一代测序 (NGS) 数据。当NGS面板目标可能完全不存在时，DETEQT擅长进行诊断呼叫。下载 DETEQT 并将其添加到 MATLAB 路径后，在 MATLAB 命令提示符下键入“help...
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: GenomeRunner:下一代测序数据的注释和丰富-开源注意：此版本需要其他SQLite数据库文件。请与开发人员联系以获取它们。... GenomeRunner是用于自动进行基因组探索的工具。它可以对用户提供的基因组区域（SNP，ChIP-seq结合位点等）针对可从UCSC基因组浏览器获得的> ...
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: NGS-TOOLBOX:方便的工具来处理/分析下一代测序（NGS）数据-开源 NGS TOOLBOX是简单的开源Perl脚本的集合，这些脚本使用下一代测序（NGS）数据集执行基本分析和处理步骤。每个工具的设计都是为了确保方便，直观地使用。安装和使用不需要任何生物信息学技能。所有脚本都是开箱即...
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: rvtests:罕见的变体测试软件可用于下一代测序数据目录负担测试可变阈值模型内核模型荟萃分析模型实用新型关联测试选项样本包含/排除多种网站过滤器注解基因型过滤器处理缺失的基因型和表型指定组（例如负担单位）性染色体分析亲缘关系产生资源UCSC RefFlat基因基因...
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: PPSeq: Parallel NGS Analysis:下一代测序（NGS）分析的并行处理-开源高通量下一代测序（NGS）技术已Swift成为生物医学研究许多方面的强大工具。但是，随着NGS的快速发展，其数据量和分析复杂性远远超过了传统的小型计算设施的能力，例如独立工作站上的多线程算法。为了解决这个问题...
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: 论文研究 - 一种无需供体来源材料的新型下一代测序方法，可用于实体器官移植中的急性排斥和感染监测基于下一代测序法定量ddcf DNA的当前方法尽管很有希望，但由于可能无法获得供体样品，因此可能会受到供体材料需求的限制。方法：我们提出了一种新颖的下一代测序方法，该方法无需供体来源的材料，并使用模拟测试和...
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: seqfam:一个软件包，主要用于分析具有血统信息的家庭的下一代测序DNA数据，以识别可能引起疾病特征的稀有... 塞克法姆文档位于。要求Seqfam与Windows，Mac OS X和Linux操作系统兼容。它使用Python 3.6进行编码，但也可以由Python 2.7运行。它需要以下软件包：熊猫== 0.20.3 scipy == 0.19.1 natsort == 5.1.1 numpy == ...
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