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EasyAmplicon (易扩增子)-扩增子高通量序列分析软件流程及脚本-详细使用方法-来自刘永鑫团队的秘籍
EasyAmplicon (易扩增子)-扩增子高通量序列分析软件流程及脚本-详细使用方法-来自刘永鑫团队的秘籍
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EasyAmplicon (易扩增子)-扩增子高通量序列分析软件流程及脚本-详细使用方法——来自刘永鑫团队的秘籍
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EasyAmplicon (易扩增子)-扩增子高通量序列分析软件流程及脚本-详细使用方法-来自刘永鑫团队的秘籍
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141KB
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93KB
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alpha_diversity.csv
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unwei_unifrac.csv
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alpha_diversity.csv
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291B
weighted_nsti.tsv.gz
291B
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2
3
4
5
6
7
31
网络分析与可视化
易生信,毕生缘;培训版权所有
。
王金锋
中科院北京生科院
2020
年
1
月
5
日
2020
微生物组
—
宏基因组分析专题研讨会第
7
期
易
生
信
2
网络介绍和解读
微生物网络用法
相关性系数计算
数据格式的整理
网络图形可视化
目录
易
生
信
复杂网络
3
现
实
生
活
中
,
存
在
许
多
复
杂
网
络
。
复
杂
网
络
不
仅
是
一
种数
据
的
表
现
形式,它同样也是一种科学研究的手段。
具有
自
组
织
、
自
相
似
、
吸
引
子
、
小
世
界
、
无标度中部分或全部性质
的网络,称之为复杂网络。
易
生
信
现实网络通常具有小世界性
4
网络中大部分的节点彼此并不直接
相连
,
但绝大部分节点之间经过少
数几步就可到达
。
平均路径长度:网络中任意两个节
点之间的距离的平均值
,
其反映网
络中各个节点间的分离程度。
现实网络通常具有小的平均路径长
度,
也就是具有
“
小世界
”
特性
。
Zitnik
M,
Sosic
R, Leskovec
J. Nature Communi
cations.
2018
易
生
信
无标度性
5
网
络
中
少
数
的
节
点
拥
有
大
量
的
连
接
(
Hub
)
,
而
大
部
分
节
点
连
接
很少,节点的度数分布符合幂率分布。
通过计算网络中各个节点的连接度可对网络属性进行判断
,
度数
分布符合幂率分布的为“无标度”网络。
Zha
ng
Z, Geng
J, T
ang X. ISME Journal.
2014
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