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AmpliMethProfiler:亚硫酸氢盐测序扩增子的CpG甲基化分析-开源
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2021-05-27
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ampliMethProfiler工具提供了一种简便且用户友好的方法,可以从目标亚硫酸氢盐测序实验中提取和分析读码的表位型组成。 具体而言,ampliMethProfiler提供了一种简便且用户友好的方法,可以从目标亚硫酸氢盐测序实验中提取和分析读数的等位基因组成。 ampliMethProfiler用python语言编写,并且需要在本地安装BLAST和QIIME工具。 它可以在Linux和OS X平台上运行。 如何引用我们:“ ampliMethProfiler:用于分析目标深亚硫酸氢盐测序扩增子的CpG甲基化图谱的管道”。 Scala G.等。 BMC生物信息学(2016)17:484,DOI:10.1186 / s12859-016-1380-3
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AmpliMethProfiler_1.2.tar.gz (15个子文件)
._AmpliMethProfiler 299B
AmpliMethProfiler
ampliMethProfiler.py 9KB
._qiime_analysis.py 299B
._methylUtils.py 299B
._preprocessFasta.py 299B
qiime_analysis.py 3KB
methylUtils.py 30KB
._README.txt 299B
._AmpliMethProfiler_pipeline_help.doc 298B
AmpliMethProfiler_pipeline_help.doc 194KB
README.txt 6KB
._methProfiles.py 299B
._ampliMethProfiler.py 299B
methProfiles.py 5KB
preprocessFasta.py 2KB
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