halc:高吞吐量算法，用于长时间读取错误校正

最新消息 HALC论文已被BMC Bioinformatics接受发表！ 概述 HALC是可以对高读取量的长读取进行纠错的软件。 复制权 HALC受约束。 简短手册 系统要求 HALC适用于具有Linux操作系统的32位或64位计算机。 建议至少4GB的系统内存用于更正较大的数据集。 安装 要运行HALC，需要使用Aligner 和纠错软件 （仅适用于普通模式）。 可以通过运行Makefile： make all来编译“ src”和“ thirdparty”文件夹中的源文件以生成“ bin”文件夹。 将BLASR，LoRDEC和'bin'文件夹分别放在$ PATH中： export PATH=PATH2BLASR:$PATH ， export PATH=PATH2LoRDEC:$PATH和export PATH=PATH2bin:$PATH 。 输入项 以FASTA格式长时间读取。