barrnap:细菌核糖体RNA预测因子

巴纳普 BAsic 快速核糖体 RNA 预测器 描述 Barrnap 预测核糖体 RNA 基因在基因组中的位置。 它支持细菌（5S、23S、16S）、古细菌（5S、5.8S、23S、16S）、后生动物线粒体（12S、16S）和真核生物（5S、5.8S、28S、18S）。 它以 FASTA DNA 序列为输入，写入 GFF3 作为输出。 它使用 HMMER 3.1 附带的新nhmmer工具以 RNA:DNA 样式进行 HMM 搜索。 支持多线程，随着 CPU 的增多，可以期待大致线性的加速。 安装 要求 （仅限核心模块） （HMMER 3.x 的一部分） conda 安装或 ： conda install -c bioconda -c conda-forge barrnap 家酿 安装 (macOS) 或 (Linux)。 brew install brewsci/bio