reago:从宏基因组学数据回收16S核糖体RNA的组装工具

REAGO 1.1已在发布 不再支持REAGO 1.0。 瑞歌v1.0 从宏基因组学数据回收16S核糖体RNA的组装工具 依存关系： 地狱1.1.1 Readjoiner 1.2 Runbook： 输入：FASTA格式的双端宏基因组读取 输出：从宏基因组读取中回收的16S基因 步骤1：确定16S读取。 命令：python filter_input.py paired_end_1.fasta paired_end_2.fasta output_dir cm_dir cm_to_use num_of_CPU 示例：python filter_input.py sample_1.fasta sample_2.fasta filter_out cm ba 10 步骤2：组装16S读取。 命令：python reago.py filename.fasta -l READ_LENGT