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IsoSeq:IsoSeq3-可从单分子PacBio读取的可扩展性从头异构体发现
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2021-05-17
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IsoSeq v3 可扩展的从头异构形式发现 IsoSeq v3包含用于识别PacBio单分子测序数据中的转录本的最新工具。 从SMRT Link v6.0.0开始,这些工具将为基于IsoSeq GUI的分析应用程序提供支持。 现有工具和算法的可组合工作流程与新的群集技术相结合,可以处理性能不断提高的PacBio机器,其性能与IsoSeq版本1和2类似。从版本3.4开始,支持基于UMI和基于单元条形码的重复数据删除已添加。 可用性 可以通过bioconda软件包isoseq3安装最新版本。 请参阅我们的以获取有关安装,支持,许可,版权和免责声明的信息。 工作流程文件 变更日志 3.4.0 SMRT Link版本10.0.0 通过添加tag和dedup ,添加对UMI和单元条码处理的支持 添加refine --min-rq以支持对未过滤的<movie>.reads.bam输入进行RQ
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易三叨
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