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Flye:De Novo汇编程序,用于使用重复图进行单分子测序读取
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2021-05-12
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Flye汇编器 版本:2.8.3 Flye是从头组装的单分子测序读物,例如PacBio和Oxford Nanopore Technologies生产的读物。 它设计用于各种数据集,从小型细菌项目到大型哺乳动物规模的装配体。 该软件包代表了一条完整的管道:它将原始的PacBio / ONT读入作为输入,并输出经过修饰的重叠群。 Flye还具有特殊的元基因组组装模式。 说明书 最新更新 Flye 2.8.3版本(2021年2月10日) 减少某些超长ONT数据集的RAM消耗 修复了一些ONT数据集上的罕见人工序列插入 组件应与2.8大致相同 Flye 2.8.2版本(2020年12月12日) GFA输出的改进,大而纠结的图形的生成速度大大提高 图简化算法的速度改进 修复了一些小错误 组件应与2.8大致相同 Flye 2.8.1版本(2020年9月2日) 添加了新选项--hifi-erro
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Flye:De Novo汇编程序,用于使用重复图进行单分子测序读取 (528个子文件)
samtools.1 71KB
minimap2.1 18KB
tabix.1 6KB
bgzip.1 5KB
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wgsim.1 1KB
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sam.5 3KB
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AUTHORS 828B
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synced_bcf_reader.c 37KB
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bam_markdup.c 32KB
vcfutils.c 32KB
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hfile.c 29KB
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padding.c 26KB
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faidx.c 26KB
rANS_static.c 26KB
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sam_header.c 22KB
bcf_sr_sort.c 21KB
bam_split.c 21KB
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tabix.c 19KB
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faidx.c 13KB
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htsfile.c 8KB
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bedcov.c 7KB
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