Cerulean: Hybrid Genome Assembler-开源

Cerulean Hybrid Genome Assembler v0.1 Cerulean 使用短读取数据集（如 Illumina 双端读取）使用长读取（如 PacBio RS 长读取）扩展组装的重叠群。 Cerulean v0.1 已在考虑细菌基因组的情况下实施。 由于研究经费的变化，我无法维护和更新软件。 但是，如果您有兴趣扩展此算法，我将很乐意回答任何疑问或提供支持和评论。 该方法在 Deshpande, V., Fung, ED, Pham, S., & Bafna, V. (2013) 中有完整描述。 Cerulean：使用高吞吐量短读和长读的混合组装。 arXiv 预印本 arXiv:1307.7933。 http://arxiv.org/abs/1307.7933