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nmf的matlab代码-apobec:用于生成Buisson等人的分析/图形的代码。al。2019年
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2021-05-26
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nmf的matlab代码 由APOBEC3A和中尺度基因组特征驱动的癌症乘客热点突变 RémiBuisson 1,2 ,Adam Langenbucher 1 ,Danae Bowen 2 ,Eugene E.Kwan 1 ,Cyril H.Benes 1 ,Lee Zou 1,3 *和Michael S.Lawrence 1,3,4 * 1美国马萨诸塞州波士顿哈佛医学院马萨诸塞州综合医院癌症中心。 2加利福尼亚大学欧文分校生物化学系,美国加利福尼亚州欧文。 3美国马萨诸塞州波士顿,哈佛医学院马萨诸塞州总医院病理科。 4哈佛大学和麻省理工学院广泛研究所,美国马萨诸塞州剑桥。 *通讯作者: 李祖迈克尔·劳伦斯(Michael S. Lawrence), 马萨诸塞州综合医院癌症中心,马萨诸塞州查尔斯顿13街13号楼149-7楼。 APOBEC发夹统计分析 亚当·兰根布彻(Adam Langenbucher)和迈克尔·劳伦斯(Michael S.Lawrence) 用于从中产生分析/图形的代码 使用的语言是MATLAB。 在MATLAB v9.1.0.441655(R2016b)上构建和测试
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nmf的matlab代码-apobec:用于生成Buisson等人的分析/图形的代码。al。2019年 (251个子文件)
map_mutations_to_targets_fast.c 4KB
hist3d_fast.c 3KB
hist2d_fast.c 2KB
str2doubleq.cpp 10KB
.gitattributes 84B
.gitattributes 84B
run.m 93KB
pr.m 9KB
load_refseq.m 8KB
load_struct.m 8KB
get_refseq_introns_and_exons.m 7KB
barweb.m 7KB
process_hairpin_block_v7.m 6KB
get_from_fwb.m 6KB
genvarname.m 6KB
genome_region.m 5KB
save_struct.m 5KB
rdir.m 5KB
survey_hairpins.m 4KB
textfit_pad02.m 4KB
textfit_pad0.m 4KB
textfit.m 4KB
make_input_for_nmf.m 3KB
lego.m 3KB
legomaf.m 3KB
nmf.m 3KB
mapinto.m 3KB
listmap.m 3KB
get_context.m 3KB
verbose.m 2KB
convert_chr.m 2KB
legos.m 2KB
read_table.m 2KB
factor2lego.m 2KB
get_chrcount.m 2KB
convert_chr_back.m 2KB
multimap.m 2KB
generate_lego_96names.m 2KB
nansub.m 2KB
add_llftrr.m 2KB
concat_structs.m 2KB
load_chrlen.m 2KB
mapacross.m 2KB
load2.m 2KB
impose_default_value.m 2KB
make_numeric.m 2KB
get_longnames.m 1KB
read_dlm_file.m 1KB
concat.m 1KB
apply_aliases.m 1KB
map_mutations_to_targets_fast_wrapper.m 1KB
sort_struct.m 1KB
count.m 1KB
bar3_with_colors.m 1KB
binofit_2d.m 1KB
make_all_possible_numeric.m 1KB
merge_structs1.m 1KB
nmf_wrapper.m 1KB
matrix2lego.m 1KB
load_struct_noheader.m 1KB
collapse_nmf_input_192_to_96.m 1KB
textextra.m 983B
direc.m 982B
rename_field.m 950B
stringsplice.m 832B
collapse_Nn_64_by_strand.m 823B
merge_structs2.m 813B
demand_file.m 796B
load_cytobands.m 790B
assigninto.m 789B
dlmsep.m 729B
split.m 706B
find_newbase.m 706B
interpret_print_filename.m 672B
require_fields_with_convert.m 640B
unique_keepord.m 637B
tokens2struct.m 622B
tr.m 612B
get_categs.m 611B
lego_to_sanger.m 609B
reorder_struct.m 603B
hist2d_fast_wrapper.m 603B
grep.m 590B
slength.m 585B
make_logical.m 565B
perform_nmf.m 518B
find_dlm.m 510B
contains.m 497B
catn.m 493B
get_LEGO_colors.m 490B
display_nmf_legos.m 484B
parse.m 473B
merge_structs.m 471B
orderfields_first.m 468B
print_to_file.m 438B
my_seqrcomplement.m 405B
hist2d.m 399B
nanunique.m 388B
keep_fields_that_exist.m 376B
keep_fields.m 370B
共 251 条
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