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matlab分时代码-whiteway-et-al-2019-nbdt:Whiteway等人2019中用于运行分析的代码
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2021-05-21
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matlab分时代码使用潜在变量模型表征皮层神经元群体共有变异的非线性结构 该存储库包含用于复制Whiteway等进行的分析的代码。 利用潜在变量模型表征皮质神经元群体共有变异的非线性结构。 说明位于下面。 步骤1:获取数据 我们分析了两个公开可用的数据集。 V1数据集。 我们分析了Kohn实验室的电生理数据,该数据已由CRCNS在公开提供。 响应于在1280毫秒(200次重复)中呈现的具有12个等距方向的全对比度漂移光栅,用犹他州阵列在三只麻醉过的猕猴的主视觉皮层中记录了尖刺活动。 完整的细节可以在原始论文中找到。 如果尚未从CRCNS访问数据,则必须首先请求访问权限(详细信息)。 将包含原始数据的pvc-11目录放在目录中的任何位置; 我们稍后将在Matlab配置文件中指定位置。 PFC数据集。 我们还分析了Kiani实验室的电生理数据,该数据已在(先弓状回的种群React)处公开提供。 当三只猕猴执行方向辨别任务时,在犹他前回的8Ar区域中的犹他州阵列中记录了突刺活动。 在每项试验中,猴子都受到800毫秒的随机点运动刺激,并且在可变长度的延迟时间后,猴子通过向相应方向移动目标来报
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whiteway-et-al-2019-nbdt-master.zip (41个子文件)
whiteway-et-al-2019-nbdt-master
.gitignore 11B
README.md 11KB
scripts-gam
buildModelFitStruct.m 27KB
getGamPredictions.m 4KB
scriptFitPreviousModels.m 4KB
buildGamXmats.m 2KB
run_srlvms.sh 2KB
fitGamSeries.m 9KB
run_previous_models.sh 1KB
scriptFitSRLVMs.m 6KB
fitGams.m 7KB
fitGamsLoo.m 10KB
scriptFitGAMs.m 4KB
run_gams.sh 3KB
evalGam.m 3KB
scripts-stim-models
run_stimulus.sh 1KB
buildStimMatrix.m 1KB
fitStimModels.m 6KB
LICENSE 1KB
sim-data
createSimData.m 1KB
fit_loop.m 5KB
getIndxReps.m 288B
plotting
clean_plot.m 114B
figure_plotting.m 18KB
README.md 3KB
fig4_gam_vs_srlvm.m 4KB
model_scatter_all_plot_helper.m 1KB
fig2_iso_qi.m 2KB
model_scatter_plot_helper.m 823B
fig2_model_comparison.m 3KB
fig2_tuning_curves.m 4KB
assign_line_properties.m 3KB
preproc
kiani.m 2KB
kohn.m 2KB
util
getIndices.m 2KB
getSimpleR2.m 274B
configProjDirs.m 748B
loadData.m 850B
startup.m 174B
normalizeData.m 470B
getDatasetStrings.m 841B
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