典型相关分析matlab实现代码-TCGA-Survival:TCGA生存

典型相关分析matlab实现代码提取TCGA数据以进行生存分析的脚本。 有关与癌症有关的更多说明，请参见 资料说明 可通过，获取公开数据。 首先，安装BiocManager::install("CNTools") ，克隆存储库git clone https://github.com/zhandong/TCGA2STAT ，然后从源代码install.packages("TCGA2STAT_1.2.tar.gz", repos = NULL, type = "source") 资料准备 首先，使用misc/TCGA_preprocessing.R脚本在本地获取数据。 在本地计算机上创建一个文件夹 使用下载的数据的存储路径更改data_dir变量 逐行运行文件或获取文件 默认情况下，将下载所有癌症的RNA-seq数据并将其另存为*.rda文件 在所有其他脚本中，将data_dir变量更改为存储下载的数据的路径 分析实例 。 与已发布的相比， ， ， 分析脚本 在所有其他脚本中，“更改路径”用于存储下载的数据，“ data_dir变量 CELLX_analysis.Rmd所有TCGA癌症中所