matlab贝叶斯阈值代码贝叶斯层次可变稀疏回归模型及其在癌症蛋白质组学中的应用
作者贡献清单表
数据
抽象的
该数据集包含四种癌症(肾脏肾透明细胞癌,卵巢浆液性囊腺癌,皮肤皮肤黑色素瘤和头颈部鳞状细胞癌)的基因表达,蛋白质表达和患者的生存时间。这些基因/蛋白质是肝癌12条核心通路的关键成员那四种癌症。
可用性
我们使用TCGA-Assembler从TCGA(data.nci.nih.gov/docs/publications/tcga/?)中检索基因组,蛋白质组学和临床数据(Zhu
et
al。,2014)
描述
TCGA数据门户已移至TCGA-Assembler()或可使用其他类似软件下载数据。
代码
抽象的
该代码实现了第2节中描述的BEHAVIOR模型的MCMC算法。它允许从模型中提取后验样本,并预测生存时间以测试数据集。
描述
Matlab编译的可执行文件连同手稿一起以zip文件提交,可以在具有或不具有Matlab许可的任何平台上运行。
可选信息
可以从()下载并安装免费的MATLAB
Runtime(v9.1)。
重现性
表1和图2-6
笔记
主要功能是行为,它接受6个输入
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