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自适应k均值matlab代码-Explore2p:双光子钙成像数据交互分析
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2021-06-07
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一起 k 均值 matlab 代码 探索2p :microscope: 概括 该 GUI 用于交互式探索和可视化功能成像数据(例如来自双光子“2P”显微镜)。 它方便地将流行的预处理包的输出作为输入数据。 刺激的实验记录(以及类似的行为,在未来版本中)也被导入。 在选择单元格或时间点的子集方面,可以在 GUI 中快速整理数据。 可以对可视化的确切数据子集快速连续执行不同的分析。 该平台极大地简化了簿记和可视化,并且正在开发用于对在非完整数据集上运行的任何自定义分析进行原型设计。 GUI 中整理的所有数据也可以在 MATLAB 工作区(参见 demo\demo_workspace_interactive.m)或以脚本形式(参见 demo\demo_script.m)轻松编辑; 导入回 GUI 以进行进一步探索和可视化。 快速开始 下载代码包后,找到文件 demo_load_GUI.m 并在 MATLAB 中打开它。 运行此脚本应将正确的目录添加到 MATLAB 搜索路径。 (或者,手动添加带有子文件夹的代码文件夹)。 演示数据(仅约 90MB)应自动下载。 当 GUI 与此演示一起启动时,它应如下所示: 将鼠
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Explore2p-master.zip (46个子文件)
Explore2p-master
@ImageClass
getIndexedData.m 3KB
getTimeIndex.m 784B
setCellvsROI.m 499B
updateIndices.m 4KB
ImageClass.m 7KB
visuals
drawAnat.m 3KB
squeezeGroupIX.m 139B
getStimBar.m 3KB
getColormap.m 4KB
getviclustRange.m 2KB
drawTraces.m 8KB
refreshFigure.m 1015B
.gitattributes 66B
README.html 1.16MB
calimg
getElementIndices.m 1KB
parseVarargin.m 513B
helper
roiIX2cIX.m 174B
squeezeGroupIX.m 139B
selectCellRange.m 492B
cIX2roiIX.m 129B
selectClusterRange.m 495B
parseRange.m 406B
input
loadSessionData.m 3KB
parseStimCode.m 4KB
initSessionData.m 2KB
get_stimCode_from_frameInfo_API.m 1KB
getStimAvgTimeIndex.m 274B
demo
GUI_screenshot.PNG 347KB
demo_workspace_interactive.m 762B
demo_script.m 2KB
demo_load_GUI.m 827B
analysis
makeRegressors.m 193B
kmeans_direct.m 674B
hierClus_direct.m 442B
.Rhistory 0B
README.md 4KB
Explore2p.m 30KB
docs
screenshot_init.PNG 347KB
.gitignore 11B
_config.yml 26B
demo_load_GUI.m 838B
temp
IOdata.m 925B
Init_template.m 4KB
my_slider.m 911B
logFunction.m 105B
getDataRoot2p.m 202B
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