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CIAtah(即calciumImagingAnalyssis):一个用于单光子和双光子成像数据集钙成像分析的软件包。 http...
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2021-05-31
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CIAtah(发音为cheetah;以前是calciumImagingAnalysis [ciapkg])是用于对单光子和双光子成像数据集进行钙成像分析的软件包。 GitHub 存储库上的最新代码: https://github.com/bahanonu/calciumImagingAnalysis 。 请参阅 GitHub 或https://git.io/ciapkg_docs以获取广泛的自述文件和详细信息。 •包括一个GUI,允许用户执行大型批处理分析,可通过存储库的“ calciumImagingAnalysis”类进行访问。 • 底层函数还可用于创建无GUI、命令行就绪的分析管道。 • 包括主要的钙成像分析步骤:预处理(时空下采样、空间过滤、相对荧光等)、多种细胞提取方法、细胞分类(即将发布!)、跨会话细胞对齐等。 • 包括用于确定动物位置的代码(例如在露天试验中)。 • 支
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Cisco789
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