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SYSMOLE:SYMOLE 是一种混合计算分析工具,用于获得分子动力学方案-matlab开发
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2021-05-29
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SYSMOLE 是一种混合计算分析工具,可从刺激React细胞宏观轨迹中推导出分子动力学方案。 SYSMOLE 利用系统识别输入-输出分析来获得刺激与拉普拉斯变换域中整体细胞React之间的传递函数。 然后,它通过分类程序和施加一般生物学约束的分析步骤推导出与传递函数唯一相关的马尔可夫链状态分子动力学方案。 该工具的描述、其对噪声的鲁棒性及其在实验轨迹中的应用示例可在“使用系统识别从宏观轨迹中阐明分子动力学方案”Friborg M.、Logothetis DE、González-Maeso J.、Sealfon 中找到SC,Galocha-IragüenB.,拉斯埃拉斯安德烈斯F.和布热齐纳V.公共科学图书馆·计算生物学,2017年http://dx.doi.org/10.1371/journal.pcbi.1005376
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