# DOT-HUB Toolbox
This toolbox is a set of scripts and functions (and examples), that supports all the steps required to go from raw fNIRS/DOT/HD-DOT data to 3D and grey-matter-surface diffuse optical tomography images. Currently built around TOAST++. This toolbox was written primarily for internal use at UCL, so change requests/support may or may not be possible.
INSTALLATION:
Clone the DOT-HUB Toolbox repository to your local drive, and add it to your matlab path. You will also need:
Toast++ (http://web4.cs.ucl.ac.uk/research/vis/toast/) downloaded and in your matlab path.
Homer2 (tested with v2.8: https://www.nitrc.org/projects/homer2/) src code (not installation) downloaded and in your matlab path.
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DOT-HUB 工具箱,支持从原始 fNIRS/DOT/HD-DOT 数据到 3D 和 GM 表面图像所需的所有步骤MATLAB
共128个文件
m:66个
toml:12个
gitignore:7个
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2022-06-15
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该工具箱是一组脚本和函数(和示例),支持从原始 fNIRS/DOT/HD-DOT 数据到 3D 和灰质表面漫反射光学断层扫描图像所需的所有步骤。目前围绕 TOAST++ 构建。此工具箱主要是为 UCL 内部使用而编写的,因此可能会或可能不会更改请求/支持。
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DOT-HUB 工具箱,支持从原始 fNIRS/DOT/HD-DOT 数据到 3D 和 GM 表面图像所需的所有步骤MATLAB (128个子文件)
intensity_01.bin 72.81MB
intensity_02.bin 47.26MB
intensity_01.bin 47.26MB
intensity_01.bin 47.26MB
intensity_02.bin 47.26MB
preproPipelineExample1.cfg 421B
preproPipelineExample2.cfg 421B
preproPipelineExample1_noRegression.cfg 338B
preproPipelineExample2.cfg 338B
Example1_Polhemus.csv 2KB
Example2_Polhemus.csv 2KB
git 0B
.gitattributes 66B
.gitignore 205B
.gitignore 97B
.gitignore 85B
.gitignore 81B
.gitignore 74B
.gitignore 68B
.gitignore 50B
.gitmodules 225B
layout.json 15KB
layout.json 15KB
layout.json 15KB
LICENSE 34KB
LICENSE 34KB
LICENSE 34KB
lumo.log 13KB
lumo.log 11KB
lumo.log 11KB
DOTHUB_getTen5points.m 88KB
DOTHUB_getTissueCoeffs.m 34KB
DOTHUB_LUFR2nirs.m 27KB
DOTHUB_hmrDeconvHRF_DriftSS_Local.m 26KB
DOTHUB_LUMO2nirs.m 20KB
DOTHUB_LUMO2nirsHyper.m 19KB
DOTHUB_getPLYPoints.m 18KB
DOTHUB_reconstruction.m 16KB
read_ply.m 16KB
DOTHUB_makeMesh.m 16KB
DOTHUB_invertJacobian.m 14KB
DOTHUB_hmrSSRegressionByChannel.m 14KB
DOTHUB_makeToastJacobian.m 13KB
DOTHUB_adultMRISegmentSPM.m 13KB
DOTHUB_LUMOpolhemus2SD3D.m 12KB
loadlufr.m 12KB
DOTHUB_dataQualityCheck.m 11KB
DOTHUB_makeNIRFASTJacobian.m 9KB
DOTHUB_LUMOcreate2DSD.m 9KB
DOTHUB_runHomerPrepro.m 9KB
DOTHUB_LUMOplotArray.m 8KB
DOTHUB_writePREPRO.m 7KB
DOTHUB_plotSurfaceDOTIMG.m 6KB
DOTHUB_LUMOSD2layout.m 6KB
DOTHUB_plotIntVDist.m 5KB
DOTHUB_writeRMAP.m 5KB
DOTHUB_makeGMSensitivityMap.m 5KB
DOTHUB_plotVolumeDOTIMG.m 5KB
DOTHUB_LUMOlayout2SD.m 5KB
DOTHUB_meshRegistration.m 5KB
PipelineExample1.m 5KB
DOTHUB_writeDOTIMG.m 5KB
DOTHUB_writeMSHS.m 5KB
DOTHUB_writeJAC.m 5KB
shadedErrorBar.m 4KB
DOTHUB_writeINVJAC.m 4KB
DOTHUB_plotIntVTime.m 4KB
DOTHUB_plotVolumeImage.m 4KB
DOTHUB_plotPSD.m 4KB
PipelineExample2.m 3KB
DOTHUB_plotHRF.m 3KB
DOTHUB_movieSurfaceDOTIMG.m 3KB
DOTHUB_plotSD.m 3KB
DOTHUB_cropNIRSfile.m 3KB
DOTHUB_affineMap.m 2KB
DOTHUB_hmrConc2OD.m 2KB
DOTHUB_resampleNIRS.m 2KB
DOTHUB_LUMOplotMPU.m 2KB
DOTHUB_createNodalTissueInd.m 2KB
DOTHUB_plotSurfaceImage.m 2KB
DOTHUB_plotIntMatrix.m 2KB
DOTHUB_plotChanHist.m 1KB
DOTHUB_vol2gmMap.m 1KB
DOTHUB_plotRMAP.m 1KB
DOTHUB_writeToastQM.m 1KB
DOTHUB_nearestNode.m 1KB
PipelineTmp.m 1KB
DOTHUB_SD2linklist.m 631B
DOTHUB_affineTrans.m 433B
DOTHUB_balanceMeasListAct.m 410B
rotz.m 356B
rotx.m 355B
roty.m 354B
DOTHUB_getSDdists.m 340B
DOTHUB_ply2Mesh.m 298B
DOTHUB_range.m 288B
tmp.mat 42.77MB
T1_seg8.mat 6.08MB
groupResults.mat 206KB
greyJet.mat 700B
共 128 条
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快撑死的鱼
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