edgeR

本专辑为您列举一些edgeR方面的下载的内容,edger、edger差异表达分析、edge如何换主题等资源。把最新最全的edgeR推荐给您,让您轻松找到相关应用信息,并提供edgeR下载等功能。本站致力于为用户提供更好的下载体验，如未能找到edgeR相关内容，可进行网站注册，如有最新edgeR相关资源信息会推送给您。

阅读全文

edgeR

: edgeR说明文档进行差异表达基因筛选，包含芯片数据和RNAseq的数据，可以是多样本也可以是单样本
评级：0 浏览量：796 收藏量：0 资源大小：293KB 上传时间：2012-03-11

: edgeRUsersGuide_edgeRUsersGuide_edger学习资料_ 用于转录组分析、基因组分析等情况下使用。包括edger用法、示例等
评级：5 浏览量：167 收藏量：0 资源大小：1.28MB 上传时间：2021-10-03

: DEA.R.zip_DESeq2_R DEA_dea分析的r代码_edgeR脚本_strangertu4 脚本自动执行以下R算法: DESeq2, edgeR and limma
评级：0 浏览量：99 收藏量：0 资源大小：7KB 上传时间：2022-09-24

: 02Run_edgeR_table_loci_ANOVA.R.r 02Run_edgeR_table_loci_ANOVA.R.r
评级：0 浏览量：44 收藏量：0 资源大小：3KB 上传时间：2022-09-22

: edger:创建用于测量恒星流出腔的半张角的算法边缘创建用于测量恒星流出腔的半张角的算法。在我们完成论文发表之前，请不要在学术论文中使用（Fedriani，Duncan 2021，准备中）。
评级：0 浏览量：61 收藏量：0 资源大小：675KB 上传时间：2021-03-09

: EDGER:创建用于测量恒星流出腔的半张角的算法边缘创建用于测量恒星流出腔的半张角的算法。在我们完成论文发表之前，请不要在学术论文中使用（Fedriani，Duncan 2021，准备中）。
评级：0 浏览量：46 收藏量：0 资源大小：672KB 上传时间：2021-03-09

: DELL-R620-RAID阵列创建.docx Dell R620 RAID配置.
评级：5 浏览量：406 收藏量：0 资源大小：822KB 上传时间：2020-06-19

: cinaR:批量ATAC-seq的计算流水线 CINAR 概述 cinaR是单个包装函数，用于批量ATAC-seq（或RNA-seq）配置文件的端到端计算分析。从共识峰文件开始，它输出差异可访问... BiocManager :: install(c( " ChIPseeker " , " DESeq2 " , " edgeR " , " fgsea
评级：0 浏览量：94 收藏量：0 资源大小：3.83MB 上传时间：2021-04-08

: signe-gr-chip-seq:等位基因特异的ChiPseq分析 dex），可以与DEseq或edgeR中的相应RNAseq数据分析进行非常相似的差异分析。您还可以在DiffBind（称为DeSeq）中运行差异分析。等位基因特异性结合：生成等位基因特异性计数矩阵并执行RasQUAL（R包装）
评级：0 浏览量：86 收藏量：0 资源大小：18.38MB 上传时间：2021-05-08

: tximport:为基因水平分析导入和总结转录水平估计 doi：10.12688/f1000research.7563.1 导入转录本水平的丰度、估计的计数和转录本长度，并汇总到矩阵中以用于下游统计分析包，如 edgeR、DESeq2、limma-voom。由样本特定转录本丰度估计加权的平均转录本长度作为矩阵...
评级：0 浏览量：559 收藏量：0 资源大小：47KB 上传时间：2021-08-05

: DEApp:DEAPP闪亮的应用程序使用edgeR，limma-voom和DESeq2进行差异表达（DE）分析，以及2）。根据您提供的输入文件，使用这3种不同的DE分析方法对DE分析结果进行交叉验证。如何使用它要从github将本应用程序下载到本地PC后再运行该应用程序...
评级：0 浏览量：141 收藏量：0 资源大小：1.82MB 上传时间：2021-05-19

: 基于matlab的表情识别代码-open-analysis-atlanta:属于“亚特兰大神经科学中的开源分析”研讨会的教程的... 基因表达的性别差异，如R和edgeR包装所示。大卫·辛基维奇（David Sinkiewicz）。不仅限于Python：在Jupyter Notebook中使用Matlab进行数据分析和可视化。瑞德·莫里塞特（Rhett Morissette）。 12：15-1：00。 ...
评级：0 浏览量：93 收藏量：0 资源大小：949KB 上传时间：2021-05-21

: hppRNA:用于 RNA-Seq 分析的基于 Snakemake 的便捷无参数管道-开源 (4) 领结-eXpress-edgeR； (5) kallisto - 侦探； (6) HISAT - StringTie - Ballgown。使用本包时请引用以下论文：王大鹏。 hppRNA——一种基于 Snakemake 的方便的无参数管道，用于对大量样本进行 RNA-Seq 分析。...
评级：0 浏览量：263 收藏量：0 资源大小：13.43MB 上传时间：2021-06-28

: EpiForBioWorkshop2021 使用DESeq2，edgeR和limma的示例将用于显示如何根据假设的因果关系拟合多变量模型。在BioC2020上成功地向100多人进行了介绍，并通过添加其他实际示例，基于参与者反馈的澄清以及对现有示例的实质性修订来更新...
评级：0 浏览量：36 收藏量：0 资源大小：17KB 上传时间：2021-03-26

: Li-eQTL-2018:欧洲油菜 QTL 和 eQTL 论文的脚本从 RNAseq 计数开始，TMM 归一化并拟合 edgeR 中的 glm 模型进行基因表达分析。差异表达基因的GO富集结果显示在文件中。显示了使用 Freebayes 和 GATK 的 SNP 调用管道、来自 Feebayes 和 G
评级：0 浏览量：202 收藏量：0 资源大小：109.52MB 上传时间：2021-07-24

: RNAtools:使用多种方法处理RNA-seq数据的功能。提供一致的接口进行标准化，测试，可视化等 RNA工具一个R包，用于使用多种方法对RNA-seq数据执行... source( " http://bioconductor.org/biocLite.R " )biocLite(c( " edgeR " , " DESeq " , " DESeq2 " , " limma " , " genefilter " , " HTSFilter " )) 现在可
评级：0 浏览量：113 收藏量：0 资源大小：716KB 上传时间：2021-05-04

: RNA-seq-workshop：RNA-seq-workshop 修整质量适配器修整如何使用HISAT2在参考上比对测序读数创建参考序列对齐参考上的读数定义对齐格式SAMtools简介如何获得计数矩阵什么是注释文件如何使用featureCount 差异基因表达分析（使用DESeq2，edgeR和Limma...
评级：0 浏览量：135 收藏量：0 资源大小：2.41MB 上传时间：2021-02-15

: 定量-ChIPseq-车间：EuroBioc 2020研讨会：使用DiffBind进行ChIP和ATAC分析标题作者日期输出定量... 尽管研讨会遵循了DiffBind封装插图，但仍在讨论其他许多Bioconductor封装的使用，包括csaw ， ChIPQC ， edgeR ， DESeq2和GreyListChIP 。先决条件与会者应熟悉以下内容： R语法的基本知
评级：0 浏览量：315 收藏量：0 资源大小：401KB 上传时间：2021-02-21

: smallRNA-polymRNA:小RNA和多核糖体测序数据的处理和分析 edgeR（v3.11）生物基质（v2.46.0） HISAT2（v2.10）管道小RNA序列秀丽隐杆线虫基因组注释： C.elegans.WBCel235.96.gtf.gz 秀丽隐杆线虫参考基因组： : 成熟的秀丽隐杆线虫miRNA： : cel fastQC（1）.sh ：...
评级：0 浏览量：242 收藏量：0 资源大小：8.31MB 上传时间：2021-03-29

: heatmap-app:一个用于交互式基因表达热图可视化的闪亮应用程序它将从edgeR包创建的DGELRT对象的列表作为数据。列表中的每个位置都是实验后的名称（列表名称将显示在热图的底部）这项工作正在进行中，希望我能够添加从热图生成的基因表。目标是单击树状图节点，并使该分支中...
评级：0 浏览量：283 收藏量：0 资源大小：4.88MB 上传时间：2021-05-01

: diffanalyseR:与R中的NGS计数数据分析相关的功能 - c( " BiocParallel " , " edgeR " , " GenomicRanges " , " SummarizedExperiments " )BiocManager :: install( pk )install.packages( " remotes " )remotes :: install_github( " ATpoint/d
评级：0 浏览量：50 收藏量：0 资源大小：32KB 上传时间：2021-03-16

: matlab差分码代码-chipseq-compare:比较差分芯片seq方法和沿途重写/移植代码 matlab差分码比较差异转录因子芯片序列法该存储库包含我的一些脚本和发现，用于比较...-重写了该程序的大部分内容，因此它运行速度更快，需要复制并使用edgeR -我将介绍如何使用这三种方法，并记录它们之间的一些差异
评级：0 浏览量：57 收藏量：0 资源大小：41KB 上传时间：2021-05-26

: bulk-RNA-seq-lymphangio:淋巴管内皮细胞的RNA seq数据分析（用肿瘤分泌物组或VEGF-C处理）命令行的详细列表，用于分析从原始计数到差异表达分析（基于edgeR程序包）和基因集富集分析（使用fgsea和clusterProfiler）的大量RNA测序数据。还包括用于显示多个关联的热图的代码（heatmap.2和pheatmap程序包）
评级：0 浏览量：374 收藏量：0 资源大小：9KB 上传时间：2021-04-12

: SARTools：RNA-Seq工具的统计分析 SARTools：RNA-Seq工具的统计分析
评级：0 浏览量：156 收藏量：0 资源大小：1.37MB 上传时间：2021-02-05

: 24差异分析1-R1 24组间差异比较及可视化曼哈顿图、火山图和热图易生信2022年1月8日2022微生物组—扩增子16S分析研讨会第14期目录edgeR包计算差异OTUs/ASVs
评级：0 浏览量：71 收藏量：1 资源大小：3.04MB 上传时间：2022-08-03

: tidybulk:将转录组学带到tidyverse tidybulk-tidyTranscriptomics的一部分将转录组学带到tidyverse！该代码是根据GNU通用公共许可证的版本3发布的。网址：请也看看用于批量数据的整洁表示用于单细胞数据的整洁表示用于单细胞数据的整洁表示 ...
评级：0 浏览量：226 收藏量：0 资源大小：5.01MB 上传时间：2021-03-21

: R-analysis-scripts R分析脚本使用edgeR，GAGE，SPIA等用于数据下游分析的脚本
评级：0 浏览量：43 收藏量：0 资源大小：15KB 上传时间：2021-05-25

: DELL CCC Certificate.pdf E38S、Power EdgeR740/740xd/R749/R7425、PrecisionR7920Rack等DELL服务器CCC认证证书
评级：0 浏览量：647 收藏量：0 资源大小：2.43MB 上传时间：2020-05-26

: RNA-seq Data Analysis a practical approach.zip RNA-seq数据分析实用方法, 介绍了RNA-seq分析的很多方法，比如edgeR，limma包等。
评级：0 浏览量：583 收藏量：0 资源大小：10.99MB 上传时间：2020-03-28

资源推荐

相关资源标签

RNAseq edgeR 生物信息 R语言 BioConductor Dell、R620、服务器 RAID rna-seq reproducible-research edger JupyterNotebook pipe tidyverse bioconductor tidy transcriptomics tsne redundancy gsea Dockerfile Shell HTML 系统开源开源软件 rnaseq