多重测序

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多重测序

: 论文研究 - SOLiD平台上多重测序的数据分析：表征和可靠性提高的概率方法因此，我们在本文中提出了一种概率模型，该模型考虑了每个测序的内在特征来表征多重运行并过滤低质量数据，从而提高了在SOLiD上进行的多重测序的数据分析可靠性。结果表明，所提出的模型是令人满意的，这归因于：1...
评级：0 浏览量：149 收藏量：0 资源大小：648KB 上传时间：2020-05-31

: multipsq:多重焦磷酸测序实验中的热解图分析-开源该软件可根据在Pyro-Mark ID系统（Qiagen）上执行的多重焦磷酸测序算法的结果对生物进行分类。可以使用可从https://sourceforge.net/projects/mpsqed/获得的mpsqed软件设计分析方法。焦磷酸测序可用于基于单核苷酸...
评级：0 浏览量：112 收藏量：0 资源大小：1.36MB 上传时间：2021-04-29

: mPSQed:比对编辑器和多重焦磷酸测序测定设计器-开源基于分子的诊断测定法是当今传染病的金标准，... 用于此目的的一种极其有用但未充分利用的方法是多重焦磷酸测序技术。 mPSQed是由罗伯特·科赫研究所（Robert Koch Institute）开发的程序，旨在促进此类测定的创建。
评级：0 浏览量：112 收藏量：0 资源大小：1004KB 上传时间：2021-04-29

: 利用焦磷酸测序监测益生菌处理的家禽的微生物组动力学合并，多重和测序后，通过自动鉴定样品来分析生成的PCR产物。然后，使用生物信息学管道来确定治疗门和属水平的微生物分布。总之，我们的结果表明焦磷酸测序技术是一种快速，高效且经济高效的方法，可监测益生菌对...
评级：0 浏览量：105 收藏量：0 资源大小：2.74MB 上传时间：2020-06-03

: 适用于结核分枝杆菌微测序耐药基因芯片的多重PCR体系的优化与评价 (1).pdf 适用于结核分枝杆菌微测序耐药基因芯片的多重PCR体系的优化与评价 (1).pdf
评级：0 浏览量：68 收藏量：0 资源大小：967KB 上传时间：2021-07-26

: 适用于结核分枝杆菌微测序耐药基因芯片的多重PCR体系的优化与评价.pdf 适用于结核分枝杆菌微测序耐药基因芯片的多重PCR体系的优化与评价.pdf
评级：0 浏览量：59 收藏量：0 资源大小：2.72MB 上传时间：2021-07-26

: matlab匹配滤波代码-5R:基于5R协议的SMURF测序结果的重建 rRNA的五个短区被多重扩增，随后由Illumina机器测序。使用我们的短多区域框架（SMURF）算法（Fuks等人2018），将来自这些区域的结果读取合并为一个一致的解决方案。提供了两个选项：Matlab代码和Linux的独立可执行...
评级：0 浏览量：146 收藏量：0 资源大小：142.8MB 上传时间：2021-05-24

: 高通量测序对先兆子痫患者胎盘中miRNA组成和3'添加事件的全面调查背景：为了深入了解先兆子痫中isomirR谱图和添加3'的isomiRs在先兆子痫中的潜在作用，我们通过应用SOLiD测序平台对不同先兆子痫程度的胎盘样品进行了miRNA库和3'添加事件的综合调查。主要发现：用3'非模板附加...
评级：0 浏览量：59 收藏量：0 资源大小：1.62MB 上传时间：2021-04-08

: matlab匹配滤波代码-DETEQT:诊断靶向测序裁决因此，没有做出输入读取的主要假设，只是它们代表了来自多重靶向扩增React的扩增子，并且在测定中参考仅由靶区域组成。想法是调查读物并描述每个参考序列或靶标是否存在。这意味着我们仅处理将映射到参考的读段，...
评级：0 浏览量：78 收藏量：0 资源大小：18.58MB 上传时间：2021-05-24

: PCR:基于靶向 NGS 数据分析的具有高度多重性的 PCR 建模在靶向测序数据分析中检测大量 DNA 重排是一项重要... 聚合酶链React 基于靶向 NGS 数据分析的高度多重 PCR 模拟
评级：0 浏览量：268 收藏量：0 资源大小：382KB 上传时间：2021-07-07

: 胶州湾多重耐药菌中整合子基因研究 (2008年) 本文采用PCR、克隆测序等方法对多重耐药菌株中Ⅰ、Ⅱ型整合酶及整合子中耐药基因盒的分布进行检测。研究发现，胶州湾多抗性细菌污染严重50％的多重耐药菌携带整合子；整合子阳性菌株对多种抗生素的耐药率远大于整合...
评级：0 浏览量：37 收藏量：0 资源大小：259KB 上传时间：2021-05-31

: iCAS - An Illumina Clone Assembly System:使用SOAPdenovo和ABySS的Illumina克隆装配系统-开源然而，由于通过多重测序引入的不同数据特征，使用当前的全基因组组装者获得的组装体经常被碎片化，并且有时具有基因组完整性的问题。使用iCAS，数据过滤过程基于新颖的kmer频率算法，从而实现了近乎完美的预组装...
评级：0 浏览量：60 收藏量：0 资源大小：47.97MB 上传时间：2021-04-30

: matlab代码不反应-CRISPR-TN5:用于CRISPR介导的基因组编辑无偏测序的分析代码图1-多重基因组编辑的可能结果基于Tn5的浓缩如何工作图2-用于基因组编辑分析的Nextera富集概述代码如何工作图3-代码工作原理概述在.fastq或.fastq.gz中读入fastq文件删除错误的事件 Bin读为以下内容之一： ...
评级：0 浏览量：89 收藏量：0 资源大小：319KB 上传时间：2021-05-26

: SIMM:SIMM：同时识别多个突变-开源 SIMM（多重突变的同时识别）管道提供了一个工作流程，将干净的读数与参考基因组对齐，在突变体和参考基因组之间调用 SNP，然后对 SNP 进行基因分型并同时识别来自不同突变体的因果突变，而无需野生型祖细胞的测序...
评级：0 浏览量：174 收藏量：0 资源大小：9.39MB 上传时间：2021-06-29

: sapovirus-evolution:在这里，我存储了许多与Sapovirus进化研究相关的脚本。这些脚本与（1）挖掘基因型间的... 然后，使用由Quick等，Nat.Natl.Acad.Sci.USA 90：1593-2593公开的多重扩增子测序方案对沙波病毒基因组进行测序。协议（）。我使用Grubaugh等人评估的方法比较了GI.1和GI.2种群之间的宿主内和宿主间单核苷酸变异（ ...
评级：0 浏览量：85 收藏量：0 资源大小：6.84MB 上传时间：2021-03-21

: demuxlet:条码单细胞RNA-seq的遗传多路复用去胶粒条码单细胞RNA-seq的遗传多路复用 ...demuxlet是一种软件工具，可通过条形码单细胞测序合并多个样品，从而对样品身份进行反卷积并识别多重峰。 demuxlet使用（1）标准10x测序平台生成的SAM / BAM / CRAM文件，
评级：0 浏览量：565 收藏量：0 资源大小：5.44MB 上传时间：2021-05-22

: ExScaliburSMD 它被设计为灵活，健壮，并利用多重对齐和变体调用算法。该管道被设计为可扩展管理数十至数百个样品的分析准确超过99％的变体检测灵敏度和准确性提交一份主脚本，自动完成从QC到带注释的体细胞变体的完整分析...
评级：0 浏览量：29 收藏量：0 资源大小：4.51MB 上传时间：2021-05-12

: matlab代码影响-Baysor:空间转录组学数据的贝叶斯分割基于原位测序或多重RNA荧光原位杂交的新方案可记录单个分子在固定组织切片中的位置。但是，在单个细胞级别分析此类数据需要准确识别细胞边界。尽管许多现有方法都可以使用细胞核染色剂来估计细胞中心的位置，但...
评级：0 浏览量：137 收藏量：0 资源大小：90KB 上传时间：2021-05-22

: DART-seq:与DART-seq技术相关的文件，包括转录组分析，图像分析和病毒遗传分析 DART序列在以下工作中生成与病毒感染有关的数据和图形的管道：Saikia，Burnham等人的“同时在单个细胞中进行多重扩增子测序和转录组分析”，目前正在审查中。与DART-seq技术有关的文件包括：A）Image_Analysis-用于...
评级：0 浏览量：261 收藏量：0 资源大小：251.97MB 上传时间：2021-05-18

: 液相芯片快速检测结核耐药基因方法建立 (2012年) 结合多重PCR技术,以5'生物素标记引物为信号指示,在H37RV结核标准株做对照下,对104株结核分枝杆菌分离株的LFP耐药rpoB基因和 INH耐药的katG, inhA基因进行检测,并与药敏试验绝对浓度法和测序结果比较．结果表明:液相...
评级：0 浏览量：66 收藏量：0 资源大小：566KB 上传时间：2021-05-30

: PangenomeVis:交互式，基于JavaScript的微生物全基因组图浏览器图基因组是一种数据结构（通常是顶点，边线和样本元数据的多重图），其中包含许多参考基因组以及感兴趣样本的测序数据。来自一个或多个基因组的子序列由顶点表示，而子序列之间的相邻性由边缘表示。每个边缘都...
评级：0 浏览量：83 收藏量：0 资源大小：39.71MB 上传时间：2021-05-10

: β-甘露聚糖酶基因克隆与在大肠杆菌中表达 (2005年) 为了通过基因工程方法在大肠杆菌中发酵生产β-甘露聚糖酶,采用多重比较几种来源的β-甘露聚糖酶氨基酸序列,获得了该酶的保守结构域,并按此设计简并引物.以能水解魔芋葡甘聚糖的枯草杆菌属野生筛选菌种A33为材料,通过...
评级：0 浏览量：54 收藏量：0 资源大小：453KB 上传时间：2021-06-14

: E-coli整合酶检测方法研究 (2012年) 试验采用梯度PCR方法确定扩增整合酶最佳温度，以该温度扩增247株菌整合酶,并对PCR产物鉴定测序，确定整合酶类型。结果表明，247株菌中有158株菌扩增出了Ⅰ型整合酶，13株菌扩增出了Ⅱ型整合酶，总共有171株菌扩增出...
评级：0 浏览量：63 收藏量：0 资源大小：745KB 上传时间：2021-05-25

: 基于线粒体控制区变异的水牛群体遗传分析 (2013年) loop区差异与进化关系,对26头广西本地水牛、8头贵州贵阳水牛、11头广西水牛与河流型水牛杂交后代、9头尼里拉菲和12头摩拉水牛(共5个群体66头水牛个体)的线粒体全长D-loop序列进行了扩增测序分析.结果发现66头水牛912...
评级：0 浏览量：56 收藏量：0 资源大小：1.21MB 上传时间：2021-05-20

: 菌B49乙醛乙醇脱氢酶基因克隆中的引物设计 (2008年) 为研究乙醛乙醇脱氢酶基因及其在乙醇发酵生物制氢中的重要作用，采用clustalw对12个菌种的乙醛乙醇脱氢酶蛋白质序列进行多重比对分析，共得到6个保守区，以这6个保守区设计引物，共选用9对简并引物，命名为ADHJ1、...
评级：0 浏览量：61 收藏量：0 资源大小：350KB 上传时间：2021-05-17

: MC4R基因多态性与鸡生长和体组成性状的相关研究 (2006年) 实验以东北农业大学建立的高低脂双向选择肉鸡品系为研究材料，采用PCR-SSCP和测序方法检测MC4R基因编码区的SNPs，结果在编码区发现1个G315T的突变。最小二乘分析表明，该位点基因型在高低脂系6世代中与7周龄体重、屠...
评级：0 浏览量：55 收藏量：0 资源大小：5.1MB 上传时间：2021-05-08

: 论文研究 - 尼日利亚西南部牛犊群中的A组轮状病毒基因型及其对人类轮状病毒疫苗效率的影响通过从阳性样品中提取来分离轮状病毒基因组，通过一步反转录聚合酶链反应（RT-PCR）进行逆转录和扩增，并通过半巢式多重PCR进行基因分型。基因型样品的代表性PCR产物经纯化并使用Sanger法测序。生成的查询序列被...
评级：0 浏览量：136 收藏量：0 资源大小：432KB 上传时间：2020-05-15

: MIDesigner-开源 MIDesigner（MID智能设计器）是一种实用程序，可设计用于测序项目的多重标识符（MID）引物。因此，它的意图类似于Barcrawl。
评级：0 浏览量：30 收藏量：0 资源大小：38KB 上传时间：2021-04-28

: DNAStar软件 DNAstar是分子生物实验室常用的序列分析软件。该软件由EditSeq MegAlign、GeneQuest MapDraw PrimerSelect Protean SeqMan II七个模块...多重序列的比较和两两序列比较；寡核苷酸设计（PCR引物，测序引物，探针）。
评级：5 浏览量：1640 收藏量：15 资源大小：28.25MB 上传时间：2012-08-15

: DNAstar使用说明 MegAlign：以配对形式（pairwise）或多重比对形式分析，并构建系统进化树。 GeneMan：利用由序列相似性、共有序列和文本术语构成的布尔查询（Boolean querise）搜索序列数据。 PrimerSelect：设计用于PCR、测序、...
评级：0 浏览量：1837 收藏量：2 资源大小：1.29MB 上传时间：2010-06-25

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