没有合适的资源?快使用搜索试试~ 我知道了~
fastp:超快速的多合一FASTQ预处理器(QCadapters整理过滤分离拆分合并...)
共73个文件
h:40个
cpp:26个
fq:2个
5星 · 超过95%的资源 需积分: 41 5 下载量 13 浏览量
2021-04-27
14:31:16
上传
评论
收藏 159KB ZIP 举报
温馨提示
快 一种工具,旨在为FastQ文件提供快速的多合一预处理。 该工具是用C ++开发的,支持多线程以提供高性能。 来自STDIN的输入 存储未配对的PE数据读取 存储使过滤器失败的读取 仅处理部分数据 不要覆盖现有文件 将输出拆分为多个文件以进行并行处理 合并PE读取 过滤 质量过滤器 长度过滤器 低复杂度滤波器 其他过滤器 适配器 每次阅读按质量得分进行切割 PE数据的基础校正 整体修剪 polyG尾部修剪 polyX尾部修剪 唯一分子识别码(UMI)处理UMI示例 输出分割 通过限制文件数量进行分割 通过限制每个文件的行来拆分 过度代表序列分析 合并配对末端读取 所有选项 引文 特征 过滤数据前后的全面质量分析(质量曲线,基本含量,KMER,Q20 / Q30,GC比率,重复,衔接子含量...) 过滤掉错误的读数(质量太低,太短或太多N ...) 通过评估滑动窗口的平均质量(例如
资源推荐
资源详情
资源评论
收起资源包目录
fastp-master.zip (73个子文件)
fastp-master
.travis.yml 98B
testdata
R1.fq 3KB
R2.fq 3KB
LICENSE 1KB
src
stats.cpp 29KB
duplicate.cpp 4KB
filterresult.cpp 15KB
adaptertrimmer.h 859B
options.cpp 20KB
threadconfig.h 2KB
cmdline.h 18KB
sequence.h 363B
seprocessor.cpp 16KB
knownadapters.h 30KB
htmlreporter.cpp 17KB
duplicate.h 710B
fastareader.cpp 3KB
evaluator.cpp 21KB
peprocessor.cpp 30KB
util.h 6KB
fastareader.h 1KB
writerthread.h 953B
fastqreader.cpp 6KB
unittest.h 233B
overlapanalysis.h 761B
options.h 9KB
evaluator.h 1007B
common.h 2KB
umiprocessor.cpp 2KB
sequence.cpp 1KB
filterresult.h 2KB
adaptertrimmer.cpp 5KB
nucleotidetree.cpp 3KB
polyx.h 581B
peprocessor.h 2KB
overlapanalysis.cpp 5KB
filter.h 601B
read.h 1KB
basecorrector.h 551B
htmlreporter.h 1KB
read.cpp 7KB
filter.cpp 8KB
writerthread.cpp 2KB
umiprocessor.h 406B
main.cpp 27KB
threadconfig.cpp 4KB
basecorrector.cpp 3KB
nucleotidetree.h 628B
jsonreporter.h 731B
writer.h 714B
processor.cpp 379B
polyx.cpp 3KB
stats.h 3KB
fastqreader.h 1KB
jsonreporter.cpp 6KB
writer.cpp 2KB
zlib
zlib.h 86KB
deflate.h 12KB
trees.h 8KB
inffixed.h 6KB
inffast.h 427B
zutil.h 7KB
crc32.h 30KB
zconf.h 15KB
inflate.h 6KB
gzguts.h 6KB
inftrees.h 3KB
processor.h 278B
unittest.cpp 1KB
seprocessor.h 2KB
.gitignore 287B
Makefile 935B
README.md 38KB
共 73 条
- 1
流浪的夏先森
- 粉丝: 29
- 资源: 4688
上传资源 快速赚钱
- 我的内容管理 展开
- 我的资源 快来上传第一个资源
- 我的收益 登录查看自己的收益
- 我的积分 登录查看自己的积分
- 我的C币 登录后查看C币余额
- 我的收藏
- 我的下载
- 下载帮助
最新资源
- 顺丰API查询快递单基于顺丰丰桥SDK开发的用易语言源码 免开发调用 需要收寄人手机号码后四位+单号查询 简单对接接口,快速开发必备 .zip
- 随着前端技术越来越成熟,JS,TS已成为各大厂开发的必备使用语言,本站从易到难深入理解JS,TS,同时提供TS做题功能,让你边学边实践,快速掌握.zip
- 通过中缀、后缀实现一个四则运算器,并设计求解界面,由于我喜欢前端嘛,用前端语言实现起来容易以及界面写起来很顺手 .zip
- 该项目是一个使用TypeScript实现的简易版Web系统框架,旨在提供一套搭建Web应用程序的基础设施 它具备以下主要特点和功能1. 虚拟文件系统2. 语言系统3. 常用接口集合.zip
- 网页编辑器,拖拽读取文件,保存文件,支持大部分编程语言文件编辑,简单易用,无需安装,这正是我想要的.zip
- 电力系统分析:基于VBA的分布式电源最佳接入点判定方法与程序实现
- MATLAB实现线性代数方程组直接解法算法解析与实践案例
- 基于MATLAB的线性代数方程组雅克比迭代解法研究与应用
- 基于MATLAB实现的线性代数方程组高斯消去法解析与应用
- MATLAB实现拉格朗日插值多项式的数值计算方法
资源上传下载、课程学习等过程中有任何疑问或建议,欢迎提出宝贵意见哦~我们会及时处理!
点击此处反馈
安全验证
文档复制为VIP权益,开通VIP直接复制
信息提交成功
- 1
- 2
前往页