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lumol:通用可扩展分子模拟引擎
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2021-05-29
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Lumol分子模拟引擎 Lumol 是一个经典的分子模拟引擎,为开发新的算法和方法提供了坚实的基础。 使用 Lumol,您可以自定义模拟中所有算法的行为。 添加新的力场、自定义蒙特卡罗运动或分子动力学积分器很容易且有据可查。 Lumol 的目标是灵活、可靠和可扩展。 对我们来说,这意味着这个软件应该是: 灵活:代码可以模拟各种系统,从蛋白质到晶体,使用各种方法:分子动力学、蒙特卡罗等。 可靠:代码在功能级别上都经过了良好的测试; 在仿真级别上,检查系统的热力学性质; 可扩展:代码是模块化的、面向对象的、文档齐全、开源且易于阅读。 Lumol 正在积极开发,应该被视为 alpha 软件。 如果您有兴趣、有疑问或想参与,可以打开或进入项目。 特征 对、分子和静电相互作用(使用 Ewald 或 Wolf 方法); 能量最小化; NVE、NVT 和 NPT 集合中的分子动力学模拟;
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米丝梨
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