trj_cavity-开源

trj_cavity在整个分子动力学（MD）模拟轨迹中发现蛋白质空腔。 该程序可处理PDB格式的文件，但也可以读取/生成GROMACS兼容格式，例如XTC。 可以将同一项目编译为GROMACS工具或独立版本。 安装说明在项目的INSTALL文件和https://sourceforge.net/p/trjcavity/wiki/Home/#ffad中提供。如果您需要使用此工具的支持（或报告错误），请在讨论中发布它。论坛。 备注：v2并行运行，并支持GROMACS v5.1 +系列。 如果要继续使用GROMACS v4.x，请使用trj_cavity_v1.1。