raxml_ascbias:用于删除或计算RAxML确定偏差校正的不变位点的脚本

raxml_ascbias Python 3脚本，用于从PHYLIP文件中删除和计数不变的位点以用于RAxML 8.2.X确定偏差校正 该脚本会删除所有不变的位点，并为Felsenstein和Stamatakis确定偏差校正生成输出文件。 现在，它一次执行所有三个步骤。 脚本也进行了优化，并且现在变得更快。 我在273秒内在107个个人和1,094,776个站点上的PHYLIP文件上运行了它。 注意：它占用大量内存。 在我的PC上，当使用具有1,000,000个以上站点的文件时，它使用了大约3或4 GB的RAM。 依存关系： numpy pandas biopython 您将需要每个依赖项的Python 3版本。 可以使用Anaconda或apt-get或pip轻松安装它们。 输出文件： out.phy：除去了不变位点的PHYLIP文件。 out.phy.felsenstein：