uce2speciestree：管线脚本，用于根据网状结点比对生成ASTRAL和SVD四重奏的输入文件

uce2speciestree 迈克尔·坎帕纳（Michael G.Campana），2019年史密森尼保护生物学研究所 管道脚本生成的输入文件和从集合 UCE位点比对中关系的格式。 执照 该软件根据史密森尼学会。 安装 在终端中： git clone https://github.com/campanam/uce2speciestree cd uce2speciestree; chmod +x uce2speciestree.rb 组态 该管道使用SGE对Smithsonian高性能计算集群（Hydra）进行了硬编码。 它需要RAxML和Ruby，并将这些软件作为模块加载。 如果不手动编辑脚本，该代码将无法在其他群集上运行。 假设配置了类似的SGE集群，则要更改的模块和可执行文件位于write_array_qsub方法中。 该软件“按原样”提供，可以作为有用的参考，但是目前尚无开发通